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Enregistrement W4321016685 · doi:10.1101/2023.02.15.23285584

Post-COVID syndrome is associated with capillary alterations, macrophage infiltration and distinct transcriptomic signatures in skeletal muscles

2023· preprint· en· W4321016685 sur OpenAlexaff
Tom Aschman, Emanuel Wyler, Oliver Baum, Andreas Hentschel, Franziska Legler, Corinna Preuße, Lil Meyer‐Arndt, Ivana Büttnerova, Alexandra Förster, Derya Cengiz, Luiz Gustavo Teixeira Alves, Julia Schneider, Claudia Kedor, R. E. Rust, Judith Bellmann–Strobl, Sanchin Aminaa, Peter Vajkoczy, Hans‐Hilmar Goebel, Markus Landthaler, Victor M. Corman, Andreas Roos, Frank L. Heppner, Helena Radbruch, Friedemann Paul, Carmen Scheibenbogen, Werner Stenzel, Nora F. Dengler

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLong-Term Effects of COVID-19
Établissements canadiensInnovation Cluster (Canada)
Organismes subventionnairesEuropean Commission
Mots-clésTranscriptomeImmune systemSkeletal muscleCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Infiltration (HVAC)MedicineSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)ImmunologyBiologyPathologyInternal medicineGeneGene expressionDiseaseGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The SARS-CoV-2 pandemic not only resulted in millions of acute infections worldwide, but also caused innumerable cases of post-infectious syndromes, colloquially referred to as “long COVID”. Due to the heterogeneous nature of symptoms and scarcity of available tissue samples, little is known about the underlying mechanisms. We present an in-depth analysis of skeletal muscle biopsies obtained from eleven patients suffering from enduring fatigue and post-exertional malaise after an infection with SARS-CoV-2. Compared to two independent historical control cohorts, patients with post-COVID exertion intolerance had fewer capillaries, thicker capillary basement membranes and increased numbers of CD169 + macrophages. SARS-CoV-2 RNA could not be detected in the muscle tissues, but transcriptomic analysis revealed distinct gene signatures compared to the two control cohorts, indicating immune dysregulations and altered metabolic pathways. We hypothesize that the initial viral infection may have caused immune-mediated structural changes of the microvasculature, potentially explaining the exercise-dependent fatigue and muscle pain.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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