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Enregistrement W4321089634 · doi:10.3389/fpubh.2023.1059238

Assessing thermal adaptation of a global sample of Aspergillus fumigatus: Implications for climate change effects

2023· article· en· W4321089634 sur OpenAlexafffundabout
Greg Korfanty, Erin Joy Heifetz, Jianping Xu

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Public Health · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueEssential Oils and Antimicrobial Activity
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMichael G. DeGroote Institute for Infectious Disease Research, McMaster UniversityMcMaster University
Mots-clésAspergillus fumigatusAdaptation (eye)Climate changeSample (material)BiologyMedicineComputational biologyEcologyMicrobiologyChemistryNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aspergillus fumigatus is a common environmental mold and a major cause of opportunistic infections in humans. It's distributed among many ecological niches across the globe. A major virulence factor of A. fumigatus is its ability to grow at high temperature. However, at present, little is known about variations among strains in their growth at different temperatures and how their geographic origins may impact such variations. In this study, we analyzed 89 strains from 12 countries (Cameroon, Canada, China, Costa Rica, France, India, Iceland, Ireland, New Zealand, Peru, Saudi Arabia, and USA) representing diverse geographic locations and temperature environments. Each strain was grown at four temperatures and genotyped at nine microsatellite loci. Our analyses revealed a range of growth profiles, with significant variations among strains within individual geographic populations in their growths across the temperatures. No statistically significant association was observed between strain genotypes and their thermal growth profiles. Similarly geographic separation contributed little to differences in thermal adaptations among strains and populations. The combined analyses among genotypes and growth rates at different temperatures in the global sample suggest that most natural populations of A. fumigatus are capable of rapid adaptation to temperature changes. We discuss the implications of our results to the evolution and epidemiology of A. fumigatus under increasing climate change.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,874
Score d'incertitude au seuil0,234

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,092
Tête enseignante GPT0,321
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2023
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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