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Enregistrement W4321105688 · doi:10.3389/fnimg.2023.1119539

Generating dynamic carbon-dioxide traces from respiration-belt recordings: Feasibility using neural networks and application in functional magnetic resonance imaging

2023· article· en· W4321105688 sur OpenAlexafffund
Vismay Agrawal, Xiaole Zhong, J. Jean Chen

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Neuroimaging · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensUniversity of TorontoBaycrest Hospital
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchVanderbilt University
Mots-clésRespirationFunctional magnetic resonance imagingContext (archaeology)Dynamic functional connectivityResting state fMRICommunication noiseComputer scienceCarbon dioxideGround truthRespiration rateNoise (video)Artificial intelligenceBiological systemPattern recognition (psychology)ChemistryNeurosciencePsychologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction In the context of functional magnetic resonance imaging (fMRI), carbon dioxide (CO 2 ) is a well-known vasodilator that has been widely used to monitor and interrogate vascular physiology. Moreover, spontaneous fluctuations in end-tidal carbon dioxide (PETCO 2 ) reflects changes in arterial CO 2 and has been demonstrated as the largest physiological noise source for denoising the low-frequency range of the resting-state fMRI (rs-fMRI) signal. However, the majority of rs-fMRI studies do not involve CO 2 recordings, and most often only heart rate and respiration are recorded. While the intrinsic link between these latter metrics and CO 2 led to suggested possible analytical models, they have not been widely applied. Methods In this proof-of-concept study, we propose a deep-learning (DL) approach to reconstruct CO2 and PETCO2 data from respiration waveforms in the resting state. Results We demonstrate that the one-to-one mapping between respiration and CO 2 recordings can be well predicted using fully convolutional networks (FCNs), achieving a Pearson correlation coefficient (r) of 0.946 ± 0.056 with the ground truth CO 2 . Moreover, dynamic PETCO 2 can be successfully derived from the predicted CO 2 , achieving r of 0.512 ± 0.269 with the ground truth. Importantly, the FCN-based methods outperform previously proposed analytical methods. In addition, we provide guidelines for quality assurance of respiration recordings for the purposes of CO 2 prediction. Discussion Our results demonstrate that dynamic CO 2 can be obtained from respiration-volume using neural networks, complementing the still few reports in DL of physiological fMRI signals, and paving the way for further research in DL based bio-signal processing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,579
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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