Distinct functions of FASCICLIN-LIKE ARABINOGALACTAN PROTEINS relate to domain structure
Notice bibliographique
Résumé
The role of glycoproteins as key cell surface molecules during development and stress is well established; yet, the relationship between their structural features and functional mechanisms is poorly defined. FASCICLIN-LIKE ARABINOGALACTAN PROTEINs (FLAs), which impact plant growth and development, are an excellent example of a glycoprotein family with a complex multidomain structure. FLAs combine globular fasciclin-like (FAS1) domains with regions that are intrinsically disordered and contain glycomotifs for directing the addition of O-linked arabinogalactan (AG) glycans. Additional posttranslational modifications on FLAs include N-linked glycans in the FAS1 domains, a cleaved signal peptide at the N terminus, and often a glycosylphosphatidylinositol (GPI) anchor signal sequence at the C terminus. The roles of glycosylation, the GPI anchor, and FAS1 domain functions in the polysaccharide-rich extracellular matrix of plants remain unclear, as do the relationships between them. In this study, we examined sequence-structure-function relationships of Arabidopsis (Arabidopsis thaliana) FLA11, demonstrated to have roles in secondary cell wall (SCW) development, by introducing domain mutations and functional specialization through domain swaps with FLA3 and FLA12. We identified FAS1 domains as essential for FLA function, differentiating FLA11/FLA12, with roles in SCW development, from FLA3, specific to flowers and involved in pollen development. The GPI anchor and AG glycosylation co-regulate the cell surface location and release of FLAs into cell walls. The AG glycomotif sequence closest to the GPI anchor (AG2) is a major feature differentiating FLA11 from FLA12. The results of our study show that the multidomain structure of different FLAs influences their subcellular location and biological functions during plant development.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».