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Enregistrement W4321253628 · doi:10.3390/biology12020319

Identification of Wnt/β-Catenin- and Autophagy-Related lncRNA Signature for Predicting Immune Efficacy in Pancreatic Adenocarcinoma

2023· article· en· W4321253628 sur OpenAlexaff
Hao Lyu, Jiahui Zhang, Qian Wei, Yuan Huang, Rui Zhang, Shuai Xiao, Dong Guo, Xing‐Zhen Chen, Cefan Zhou, Jingfeng Tang

Notice bibliographique

RevueBiology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related molecular mechanisms research
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesWuhan Science and Technology ProjectHubei UniversityHubei University of TechnologyNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiologyNomogramOncologyReceiver operating characteristicMalignancyInternal medicineWnt signaling pathwayProportional hazards modelUnivariateAutophagyCancer researchMultivariate statisticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pancreatic cancer is one of the tumors with a poor prognosis. Therefore, it is significant and urgent to explore effective biomarkers for risk stratification and prognosis prediction to promote individualized treatment and prolong the survival of patients with PAAD. In this study, we identified Wnt/β-catenin- and autophagy-related long non-coding RNAs (lncRNAs) and demonstrated their role in predicting immune efficacy for PAAD patients. The univariate and multivariate Cox proportional hazards analyses were used to construct a prognostic risk model based on six autophagy- and Wnt/β-catenin-related lncRNAs (warlncRNAs): LINC01347, CASC8, C8orf31, LINC00612, UCA1, and GUSBP11. The high-risk patients were significantly associated with poor overall survival (OS). The receiver operating characteristic (ROC) curve analysis was used to assess the predictive accuracy of the prognostic risk model. The prediction efficiency was supported by the results of an independent validation cohort. Subsequently, a prognostic nomogram combining warlncRNAs with clinical indicators was constructed and showed a good predictive efficiency for survival risk stratification. Furthermore, functional enrichment analysis demonstrated that the signature according to warlncRNAs is closely linked to malignancy-associated immunoregulatory pathways. Correlation analysis uncovered that warlncRNAs' signature was considerably associated with immunocyte infiltration, immune efficacy, tumor microenvironment score, and drug resistance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,035
Score d'incertitude au seuil0,534

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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