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Enregistrement W4321351229 · doi:10.1080/15592324.2023.2180159

Effect of light conditions on trophic level and gene expression of partially mycoheterotrophic orchid, <i>Cymbidium goeringii</i>

2023· article· en· W4321351229 sur OpenAlexfundno aff
Keita Chagi, Hiroaki Komoda, Masashi Murakami

Notice bibliographique

RevuePlant Signaling & Behavior · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant and animal studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of Genetics
Mots-clésBiologyMixotrophJasmonic acidAutotrophTrophic levelBotanySymbiosisNutrientTranscriptomeCymbidiumShadingPhenotypic plasticityPhotosynthesisGeneGene expressionHeterotrophEcologyGeneticsBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Partial mycoheterotrophic i.e., mixotrophic, plants are the species which partially depend on mycorrhizal fungi for its nutrients. Although some of these plants are known to show plasticity in the degree of fungal dependence induced by the changes in light condition, the genetic background of this plasticity is largely unsolved. Here, we investigated the relationships between environmental conditions and nutrient sources based on 13C and 15N enrichment in mixotrophic orchid Cymbidium goeringii. We also shaded them for 2 months and evaluated the effect of light condition on the nutrient sources based on the abundance of 13C and 15N and the gene expressions by RNA-seq based de novo assembly. The shading had no effect on isotope enrichment, possibly because of the translocation of carbon and nitrogen from the storage organs. Gene expression analysis showed the upregulation of genes involved in jasmonic acid response in leaves of the shaded plants, which suggests that the jasmonic acid played an important role in regulation of degree of dependence against the mycorrhizal fungi. Our results suggest that mixotrophic plants might be controlling their dependency against the mycorrhizal fungi by a common mechanism with the autotrophic plants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,142
Score d'incertitude au seuil0,244

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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