MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4321367247 · doi:10.1021/acs.jmedchem.2c01933

Discovery and Characterization of BAY-805, a Potent and Selective Inhibitor of Ubiquitin-Specific Protease USP21

2023· article· en· W4321367247 sur OpenAlexafffund
Fabian Göricke, Victoria Vu, Leanna Smith, U. Scheib, Raphael Böhm, Namık Akkılıç, Gerd Wohlfahrt, Jörg Weiske, Ulf Bömer, Krzysztof Brzezinka, Niels Lindner, Philip Lienau, Stefan Gradl, Hartmut Beck, Peter J. Brown, Vijayaratnam Santhakumar, Masoud Vedadi, Dalia Baršytė-Lovejoy, C.H. Arrowsmith, Norbert Schmees, Kirstin Petersen

Notice bibliographique

RevueJournal of Medicinal Chemistry · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensStructural Genomics ConsortiumUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaHorizon 2020 Framework ProgrammeGenentechKungliga Tekniska HögskolanOntario Institute for Cancer ResearchTakeda Pharmaceutical CompanyEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsStructural Genomics ConsortiumJanssen PharmaceuticalsMerck KGaAGenome CanadaBayerBristol-Myers SquibbEuropean CommissionPfizerDiamond Light SourceMcGill UniversityBoehringer Ingelheim
Mots-clésChemistryDeubiquitinating enzymeUbiquitinSurface plasmon resonanceProteasesBiochemistryHigh-throughput screeningEnzymeSubfamilyKinaseProteasePhenotypic screeningGeneNanotechnologyPhenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

USP21 belongs to the ubiquitin-specific protease (USP) subfamily of deubiquitinating enzymes (DUBs). Due to its relevance in tumor development and growth, USP21 has been reported as a promising novel therapeutic target for cancer treatment. Herein, we present the discovery of the first highly potent and selective USP21 inhibitor. Following high-throughput screening and subsequent structure-based optimization, we identified BAY-805 to be a non-covalent inhibitor with low nanomolar affinity for USP21 and high selectivity over other DUB targets as well as kinases, proteases, and other common off-targets. Furthermore, surface plasmon resonance (SPR) and cellular thermal shift assays (CETSA) demonstrated high-affinity target engagement of BAY-805, resulting in strong NF-κB activation in a cell-based reporter assay. To the best of our knowledge, BAY-805 is the first potent and selective USP21 inhibitor and represents a valuable high-quality in vitro chemical probe to further explore the complex biology of USP21.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Medicinal ChemistryMême sujetUbiquitin and proteasome pathwaysTravaux en français237 207