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Enregistrement W4321369732 · doi:10.1038/s42255-023-00742-w

Proteome-wide Mendelian randomization implicates nephronectin as an actionable mediator of the effect of obesity on COVID-19 severity

2023· article· en· W4321369732 sur OpenAlexafffund
Satoshi Yoshiji, Guillaume Butler‐Laporte, Tianyuan Lu, Julian Willett, Chen‐Yang Su, Tomoko Nakanishi, David Morrison, Yiheng Chen, Kevin Y. H. Liang, Michael Hultström, Yann Ilboudo, Zaman Afrasiabi, Shanshan Lan, Naomi Duggan, Chantal DeLuca, Mitra Vaezi, Chris Tselios, Xiaoqing Xue, Meriem Bouab, Fangyi Shi, Lætitia Laurent, Hans Markus Münter, Marc Afilalo, Jonathan Afilalo, Vincent Mooser, Nicholas J. Timpson, Hugo Zeberg, Sirui Zhou, Vincenzo Forgetta, Yossi Farjoun, J. Brent Richards

Notice bibliographique

RevueNature Metabolism · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSingle-cell and spatial transcriptomics
Établissements canadiensMcGill University Health CentreMcGill Genome CentreMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilFonds de Recherche du Québec - SantéNational Institutes of HealthFondation de l'Hôpital général juifScience for Life LaboratoryNational Institute for Health and Care ResearchJewish General HospitalPublic Health AgencyEuropean CommissionKing's College LondonTD BankMcGill UniversityPublic Health Agency of CanadaJapan Society for the Promotion of ScienceCancer Research UKHjärt-LungfondenCanadian Institutes of Health ResearchCompute Canada
Mots-clésMendelian randomizationMediatorObesityBody mass indexBiologyCoronavirus disease 2019 (COVID-19)BioinformaticsTranscriptomeInternal medicineProteomeMedicineDiseaseGeneEndocrinologyGeneticsGene expressionGenetic variants

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations113
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentnon

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