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Enregistrement W4321377193 · doi:10.3389/fphy.2023.1161890

Editorial: Pattern formation in biology

2023· editorial· en· W4321377193 sur OpenAlexafffund
Pau Formosa-Jordan, David M. Holloway, Luis Diambra

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Physics · 2023
Typeeditorial
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueNonlinear Dynamics and Pattern Formation
Établissements canadiensBritish Columbia Institute of Technology
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMax-Planck-GesellschaftConsejo Nacional de Investigaciones Científicas y TécnicasBritish Columbia Institute of TechnologyDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésBiologyEvolutionary biologyComputational biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Over the past two decades, the study of pattern formation in biology has attracted the attention of many scientists from diverse fields, ranging from developmental biology, cell biology and synthetic biology, to physics, mathematics and computer science. Quantitative and interdisciplinary approaches have become essential for understanding these challenging phenomena. This Research Topic contains a collection of articles and reviews that use quantitative and interdisciplinary perspectives to understand the underlying mechanisms driving biological pattern formation. Modeling morphogenetic processes, gene regulatory network dynamics and morphogen gradients link the articles of this Research Topic, with a focus on three research areas: 1) underlying mechanisms of patterning processes; 2) cross-talk of morphogenetic and pattern formation processes, and 3) mathematical methods for modeling and quantifying biological patterning and morphogenesis. Below, each of the present Research Topic papers is briefly discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,014
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Éditorial · Signal consensuel: Éditorial
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil0,084

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,014
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0040,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,002
Bibliométrie0,0030,001
Études des sciences et des technologies0,0030,002
Communication savante0,0070,004
Science ouverte0,0030,001
Intégrité de la recherche0,0090,012
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0250,020

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreÉditorial

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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