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Enregistrement W4321435856 · doi:10.1101/2023.02.17.529034

Tenacibaculosis in wild-caught, captive Chinook salmon ( <i>Oncorhynchus tshawytscha</i> ) in British Columbia, Canada

2023· preprint· en· W4321435856 sur OpenAlexaffabout
Emiliano Di Cicco, Kaitlyn R. Zinn, Stephen D. Johnston, Karia H. Kaukinen, Shaorong Li, Jonathan F. Archambault, Kaleb N. R. Mantha-Rensi, Kayla A. J. Zielke, William S. Bugg, Gideon Mordecai, Arthur L. Bass, Christoph Deeg, Andrew W. Bateman, Scott G. Hinch, Kristina M. Miller

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAquaculture disease management and microbiota
Établissements canadiensUniversity of TorontoFisheries and Oceans CanadaUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChinook windOncorhynchusBiologyLethargyGillFisheryAquacultureFish <Actinopterygii>MedicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Substantial, acute mortality was observed in wild-caught Chinook salmon ( Oncorhynchus tshawytscha ) of various ages and sizes, from sub-adults to returning adults, held in tanks during two holding studies carried out in August and September 2022 at the Bamfield Marine Sciences Centre (BMSC), in Bamfield, British Columbia, Canada. Within days of capture, a substantial number of fish began presenting lethargy, loss of balance, abnormal swimming behavior, and skin ulcers involving the caudal peduncle, fins, belly, trunk and mouth. Molecular testing revealed high levels of Tenacibaculum dicentrarchi in skin swabs and gills, without appreciable consistent detections of other infectious agents. T. dicentrarchi was also isolated from the skin ulcers. Histological analysis confirmed the presence of ulcerative dermatitis and myositis, associated with mats of filamentous, rod-shaped bacteria. In two individuals, the infection became systemic, with a bacterial colony (identified as T. dicentrarchi ) observed in the liver of one individual. In-situ hybridization against T. dicentrarchi and T. maritimum confirmed the presence of only the former agent in the gills and skin ulcers of the affected fish. This clinical report represents the first diagnosed case of tenacibaculosis in wild-caught (captive) Chinook salmon in British Columbia. CONFLICT OF INTEREST The authors have no conflicts of interest to report. DATA AVAILABILITY STATEMENT The data that support the findings of this study are available from the corresponding author upon reasonable request.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,108
Score d'incertitude au seuil0,217

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,187
Écart entre enseignants0,179 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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