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Enregistrement W4321436546 · doi:10.1007/s10549-023-06872-9

Concordance of immunohistochemistry for predictive and prognostic factors in breast cancer between biopsy and surgical excision: a single-centre experience and review of the literature

2023· review· en· W4321436546 sur OpenAlexaff
Chiara Rossi, Sara Fraticelli, Marianna Fanizza, Alberta Ferrari, Elisa Ferraris, Alessia Messina, Angelica Della Valle, Chiara Annunziata Pasqualina Anghelone, Angioletta Lasagna, Gianpiero Rizzo, Lorenzo Perrone, Maria Grazia Sommaruga, Giulia Meloni, Silvia Dallavalle, Elisabetta Bonzano, Marco Paulli, Giuseppe Di Giulio, Adele Sgarella, Marco Lucioni

Notice bibliographique

RevueBreast Cancer Research and Treatment · 2023
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBreast Cancer Treatment Studies
Établissements canadiensUniversity Hospital Foundation
Organismes subventionnairesUniversità degli Studi di Pavia
Mots-clésConcordanceMedicineBiopsyBreast cancerContext (archaeology)Progesterone receptorImmunohistochemistryCancerOestrogen receptorGynecologyOncologyInternal medicineEstrogen receptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Accurate evaluation of breast cancer on bioptic samples is of fundamental importance to guide therapeutic decisions, especially in the neoadjuvant or metastatic setting. We aimed to assess concordance for oestrogen receptor (ER), progesterone receptor (PR), c-erbB2/HER2 and Ki-67. We also reviewed the current literature to evaluate our results in the context of the data available at present. METHODS: We included patients who underwent both biopsy and surgical resection for breast cancer at San Matteo Hospital, Pavia, Italy, between January 2014 and December 2020. ER, PR, c-erbB2, and Ki-67 immunohistochemistry concordance between biopsy and surgical specimen was evaluated. ER was further analysed to include the recently defined ER-low-positive in our analysis. RESULTS: We evaluated 923 patients. Concordance between biopsy and surgical specimen for ER, ER-low-positive, PR, c-erbB2 and Ki-67 was, respectively, 97.83, 47.8, 94.26, 68 and 86.13%. Cohen's κ for interobserver agreement was very good for ER and good for PR, c-erbB2 and Ki-67. Concordance was especially low (37%) in the c-erbB2 1 + category. CONCLUSION: Oestrogen and progesterone receptor status can be safely assessed on preoperative samples. The results of this study advise caution in interpreting biopsy results regarding ER-low-positive, c-erbB2/HER and Ki-67 results due to a still suboptimal concordance. The low concordance for c-erbB2 1 + cases underlines the importance of further training in this area, in the light of the future therapeutic perspectives.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,011
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,030
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,056

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0110,030
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0060,006
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,067
Tête enseignante GPT0,402
Écart entre enseignants0,335 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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