A Sequalae of Lineage Divergence in Staphylococcus aureus from Community-Acquired Patterns in Youth to Hospital-Associated Profiles in Seniors Implied Age-Specific Host-Selection from a Common Ancestor
Notice bibliographique
Résumé
The rapidly changing epidemiology of Staphylococcus aureus and evolution of strains with enhanced virulence is a significant issue in global healthcare. Hospital-associated methicillin-resistant S. aureus (HA-MRSA) lineages are being completely replaced by community-associated S. aureus (CA-MRSA) in many regions. Surveillance programs tracing the reservoirs and sources of infections are needed. Using molecular diagnostics, antibiograms, and patient demographics, we have examined the distributions of S. aureus in Ha’il hospitals. Out of 274 S. aureus isolates recovered from clinical specimens, 181 (66%, n = 181) were MRSA, some with HA-MRSA patterns across 26 antimicrobials with almost full resistances to all beta-lactams, while the majority were highly susceptible to all non-beta-lactams, indicating the CA-MRSA type. The rest of isolates (34%, n = 93) were methicillin-susceptible, penicillin-resistant MSSA lineages (90%). The MRSA in men was over 56% among total MRSA (n = 181) isolates and 37% of overall isolates (n = 102 of 274) compared to MSSA in total isolates (17.5%, n = 48), respectively. However, these were 28.4% (n = 78) and 12.4% (n = 34) for MRSA and MSSA infections in women, respectively. MRSA rates per age groups of 0–20, 21–50, and >50 years of age were 15% (n = 42), 17% (n = 48), and 32% (n = 89), respectively. However, MSSA in the same age groups were 13% (n = 35), 9% (n = 25), and 8% (n = 22). Interestingly, MRSA increased proportional to age, while MSSA concomitantly decreased, implying dominance of the latter ancestors early in life and then gradual replacement by MRSA. The dominance and seriousness of MRSA despite enormous efforts in place is potentially for the increased use of beta-lactams known to enhance virulence. The Intriguing prevalence of the CA-MRSA patterns in young otherwise healthy individuals replaced by MRSA later in seniors and the dominance of penicillin-resistant MSSA phenotypes imply three types of host- and age-specific evolutionary lineages. Thus, the decreasing MSSA trend by age with concomitant increase and sub-clonal differentiation into HA-MRSA in seniors and CA-MRSA in young and otherwise healthy patients strongly support the notion of subclinal emergences from a resident penicillin-resistant MSSA ancestor. Future vertical studies should focus on the surveillance of invasive CA-MRSA rates and phenotypes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».