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Enregistrement W4321597063 · doi:10.1038/s41598-023-29832-1

Wound swab quality grading is dependent on Gram smear screening approach

2023· article· en· W4321597063 sur OpenAlexafffund
Shawn T. Clark, Jessica D. Forbes, Larissa Matukas

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Identification and Susceptibility Testing
Établissements canadiensUniversity Health NetworkSt. Michael's HospitalCanadian Electricity AssociationUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesAssociation of Medical Microbiology and Infectious Disease Canada
Mots-clésGrading (engineering)MedicineQuality assessmentVeterinary medicinePathologyExternal quality assessmentBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Superficial skin swab collections are inherently low-quality and may be of little clinical value due to their poor sensitivity and specificity. Clinical microbiology laboratories can use Gram smears to screen and differentiate higher and lower quality specimens to direct the extent of potential pathogen work up, including antimicrobial susceptibility testing (AST). We compared the impact of two different smear grading approaches to our current reporting practices for superficial wound swab cultures. Two variations of the Q score methodology (low power under 10X (QS10) and high power under 100X (QS100) were compared to our existing oil immersion method (OM100) (100X). We further evaluated the QS100 method by scoring superficial swab smears previously screened by OM100 from cultures submitted between November 2018 and December 2019. No significant difference in the number of low-quality specimens (N = 50) was identified by QS10 or QS100 grading (N = 9; 18%; N = 8; 16% respectively). Among 968 additional QS100 screened smears, 67 (6.9%) low quality swabs were identified and 7.4% fewer organisms (76/1020 organisms) would require reporting with AST. Implementing the Q score for superficial wound swab cultures would provide minimal improvements in their clinical relevance, laboratory quality and efficiency in our laboratory due to the low number of poor-quality swabs received.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,231
Score d'incertitude au seuil0,643

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,066
Tête enseignante GPT0,326
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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