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Enregistrement W4321600113 · doi:10.1038/s41467-023-36277-7

TEFM variants impair mitochondrial transcription causing childhood-onset neurological disease

2023· article· en· W4321600113 sur OpenAlexafffund
Lindsey Van Haute, Emily O’Connor, Héctor Díaz-Maldonado, Benjamin Munro, Kiran Polavarapu, Daniella H. Hock, Gautham Arunachal, Alkyoni Athanasiou‐Fragkouli, Mainak Bardhan, Magalie Barth, Dominique Bonneau, Nicola Brunetti‐Pierri, Gerarda Cappuccio, Nikeisha J. Caruana, Natalia Dominik, Himanshu Goel, Guy Helman, Henry Houlden, Guy Lenaers, Karine Mention, David Murphy, Bevinahalli N. Nandeesh, Catarina Olimpio, Christopher A. Powell, Veeramani Preethish‐Kumar, Vincent Procaccio, Rocío Rius, Pedro Rebelo‐Guiomar, Cas Simons, Seena Vengalil, Maha S. Zaki, Alban Ziegler, David R. Thorburn, David A. Stroud, Reza Maroofian, John Christodoulou, Claes M. Gustafsson, Atchayaram Nalini, Hanns Lochmüller, Michal Minczuk, Rita Horváth

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensOttawa HospitalChildren's Hospital of Eastern OntarioUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchState Government of VictoriaVetenskapsrådetNational Health and Medical Research CouncilEvelyn TrustCanada Research ChairsNIHR Cambridge Biomedical Research CentreOffice of Health and Medical ResearchNational Institute for Health and Care ResearchDepartment of Health and Social CareKnut och Alice Wallenbergs StiftelseMurdoch Children's Research InstituteNewton FundMedical Research CouncilChildren’s Hospital of Wisconsin Research InstituteSwedish Cancer FoundationMuscular Dystrophy CanadaRoyal Children's Hospital FoundationChildren's Hospital FoundationWellcome Trust
Mots-clésBiologyMitochondrial DNADNAJA3Mitochondrial diseaseMitochondrionGeneticsGeneRNA polymerase IITranscription (linguistics)ZebrafishMyopathymitochondrial fusionCell biologyPromoterGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mutations in the mitochondrial or nuclear genomes are associated with a diverse group of human disorders characterized by impaired mitochondrial respiration. Within this group, an increasing number of mutations have been identified in nuclear genes involved in mitochondrial RNA biology. The TEFM gene encodes the mitochondrial transcription elongation factor responsible for enhancing the processivity of mitochondrial RNA polymerase, POLRMT. We report for the first time that TEFM variants are associated with mitochondrial respiratory chain deficiency and a wide range of clinical presentations including mitochondrial myopathy with a treatable neuromuscular transmission defect. Mechanistically, we show muscle and primary fibroblasts from the affected individuals have reduced levels of promoter distal mitochondrial RNA transcripts. Finally, tefm knockdown in zebrafish embryos resulted in neuromuscular junction abnormalities and abnormal mitochondrial function, strengthening the genotype-phenotype correlation. Our study highlights that TEFM regulates mitochondrial transcription elongation and its defect results in variable, tissue-specific neurological and neuromuscular symptoms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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