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Enregistrement W4321606888 · doi:10.1002/cbic.202300001

Rapid Biocatalytic Synthesis of Aromatic Acid CoA Thioesters by Using Microbial Aromatic Acid CoA Ligases

2023· article· en· W4321606888 sur OpenAlexaff
Debayan Chaudhury, Ella R. Torkelson, Kaya A. Meyers, Justin Acheson, Leta Landucci, Yucen Pu, Zimou Sun, Marco Tonelli, C.A. Bingman, Rebecca A. Smith, Steven D. Karlen, Shawn D. Mansfield, John Ralph, Brian G. Fox

Notice bibliographique

RevueChemBioChem · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueBiofuel production and bioconversion
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesBasic Energy SciencesGreat Lakes Bioenergy Research CenterOffice of ScienceNational Institutes of HealthU.S. Department of Energy
Mots-clésThioesterChemistryMonolignolCoenzyme AOrganic chemistryLigninBiochemistryEnzymeBiosynthesis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chemically labile ester linkages can be introduced into lignin by incorporation of monolignol conjugates, which are synthesized in planta by acyltransferases that use a coenzyme A (CoA) thioester donor and a nucleophilic monolignol alcohol acceptor. The presence of these esters facilitates processing and aids in the valorization of renewable biomass feedstocks. However, the effectiveness of this strategy is potentially limited by the low steady-state levels of aromatic acid thioester donors in plants. As part of an effort to overcome this, aromatic acid CoA ligases involved in microbial aromatic degradation were identified and screened against a broad panel of substituted cinnamic and benzoic acids involved in plant lignification. Functional fingerprinting of this ligase library identified four robust, highly active enzymes capable of facile, rapid, and high-yield synthesis of aromatic acid CoA thioesters under mild aqueous reaction conditions mimicking in planta activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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