Diversity in virulence and metalaxyl-m sensitivity of <i>Phytophthora rubi</i> isolates has implications for raspberry root rot and wilting complex management
Notice bibliographique
Résumé
Raspberry root rot and wilting complex (RRWC), primarily caused by Phytophthora rubi, is the most important disease for raspberry producers in Canada. There is currently little to no information on phenotypic diversity or sensitivity to metalaxyl-m of P. rubi isolates affecting raspberries in Canada. This study was conducted to understand the diversity in virulence and sensitivity to metalaxyl-m of P. rubi populations collected from diverse raspberry cultivars, fields, and locations during 2018–2020. All isolates of P. rubi (n = 24) were pathogenic on ‘Chemainus’ raspberry and showed significant variation (P < 0.05) in days to first foliar symptom development (DFSD) and progress in wilting index, as indicated by relative areas under disease progress curves (rAUDPC). Principal component analyses identified that root rot index, rAUDPC, DFSD, and percentage reduction in root length and weight were important variables in assessing pathogen virulence. Metalaxyl-m sensitivity was assessed using a radial growth assay and effective concentrations that inhibited 50% of mycelial growth (EC50) were determined for 44 isolates. The EC50 values ranged from 0.035–4.71 µg mL−1 with a mean value of 0.793 µg mL−1. About 61% of the isolates were very sensitive (EC50 values <0.20 µg mL−1), 25% of isolates were considered sensitive (EC50 values of 0.21–1.18 µg mL−1), and 14% of isolates showed reduced sensitivity to metalaxyl-m (EC50 value range of 1.19–4.71 µg mL−1). Knowledge of pathogen phenotypic diversity will be useful for raspberry breeders in screening genotypes against RRWC and the results of the fungicide sensitivity study will be useful in developing management strategies for RRWC.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».