Cohort profile: A Québec-based plasma donor biobank to study COVID-19 immunity (PlasCoV)
Notice bibliographique
Résumé
PURPOSE: The long-term humoral immunity to COVID-19 is not well understood owing to the continuous emergence of new variants of concern, the evolving vaccine-induced and infection-induced immunity, and the limited duration of follow-up in previous studies. As the sole blood service in Québec (Canada), Héma-Québec established a COVID-19-focused biobank ('PlasCoV') in April 2021. PARTICIPANTS: As of January 2022, the biobank included 86 483 plasma samples from 15 502 regular donors (age range=18-84 years, females=49.7%), for an average of 5.6 donations per donor. Nearly two-thirds (65.6%) of biobank donors made at least two donations, with many donors having provided samples prevaccination and postvaccination (3061 (19.7%)) or preinfection and postinfection (131 (0.8%)), thus allowing for longitudinal studies on vaccine-induced and infection-induced immunity. FINDINGS TO DATE: A study that used PlasCoV samples revealed that previously infected individuals who received a single dose of the BNT162b2 COVID-19 vaccine exhibited the strongest immune response. By contrast, SARS-CoV-2-naïve individuals required two vaccine doses to produce a maximal immune response. Furthermore, the results of a four-phase seroprevalence study indicated that the antinucleocapsid (N) response wanes rapidly, so that up to one-third of previously infected donors were seronegative for anti-N. FUTURE PLANS: Donations from individuals who consented to participate before 1 October 2022 will be collected up until 31 March 2023. This plasma biobank will facilitate the conduct of longitudinal studies on COVID-19 immunity, thus helping to provide valuable insights into the anti-SARS-CoV-2 immune response and its persistence, and the effects of vaccination and variants on the specificity of the anti-SARS-CoV-2 immune response.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,010 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».