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Enregistrement W4321764684 · doi:10.1101/2023.02.23.23286237

Risk factors for severe respiratory syncytial virus infection during the first year of life: development and validation of a clinical prediction model

2023· preprint· en· W4321764684 sur OpenAlexaff
Pekka Vartiainen, Sakari Jukarainen, Samuel Rhedin, Alexandra Prinz, Tuomo Hartonen, Andrius Vabalas, Essi Viippola, Rodosthenis S. Rodosthenous, Sara Kuitunen, Aoxing Liu, Cecilia Lundholm, Awad I. Smew, Emma Caffrey Osvald, Emmi Helle, Markus Perola, Catarina Almqvist, Santtu Heinonen, Andrea Ganna

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRespiratory viral infections research
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesVetenskapsrådetAcademy of FinlandKarolinska InstitutetEuropean CommissionChina Scholarship CouncilSuomen Lääketieteen SäätiöHjärt-LungfondenÅke Wiberg Stiftelse
Mots-clésLogistic regressionMedicinePercentileConfidence intervalOdds ratioPediatricsStatisticCohortRetrospective cohort studyOddsInternal medicineStatistics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Background Novel immunisation methods against respiratory syncytial virus (RSV) are emerging, but knowledge of risk factors for severe RSV disease is insufficient for their optimal targeting. We aimed to identify predictors for RSV hospitalisation, and to develop and validate a clinical prediction model to guide RSV immunoprophylaxis for under 1-year-old infants. Methods In this retrospective cohort study using nationwide registries, we studied all infants born in 1997-2020 in Finland (n = 1 254 913) and in 2006-2020 in Sweden (n = 1 459 472), and their parents and siblings. We screened 1 510 candidate predictors and we created a logistic regression model with 16 predictors and compared its performance to a machine learning model (XGboost) using all 1 510 candidate predictors. Findings In addition to known predictors such as severe congenital heart defects (CHD, adjusted odds ratio (aOR) 2·89, 95% confidence interval 2·28-3·65), we identified novel predictors for RSVH, most notably esophageal malformations (aOR 3·11, 1·86-5·19) and lower complexity CHDs (aOR 1·43, 1·25-1·63). In validation data from 2018-2020, the C-statistic was 0·766 (0·742-0·789) in Finland and 0·737 (0·710-0·762) in Sweden. The clinical prediction model’s performance was similar to the machine learning model (C-statistic in Finland 0·771, 0·754-0·788). Calibration varied according to epidemic intensity. Model performance was similar across different strata of parental income. The infants in the 90th percentile of predicted RSVH probability hospitalisation had 3·3 times higher observed risk than the population’s average. Assuming 60% effectiveness, immunisation in this top 10% of infants at highest risk would have a number needed to treat of 23 in Finland and 40 in Sweden in preventing hospitalisations. Interpretation The identified predictors and the prediction model can be used in guiding RSV immunoprophylaxis in infants. Funding Sigrid Jusélius Foundation, European Research Council, Pediatric Research Foundation (for complete list of funding sources, see Acknowledgements).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,013
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,040

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,013
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,162
Tête enseignante GPT0,403
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
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