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Enregistrement W4321764733 · doi:10.1101/2023.02.23.529792

Polarimetric response of second harmonic generation in microscopy of chiral fibrillar structures

2023· preprint· en· W4321764733 sur OpenAlexafffund
Mehdi Alizadeh, Fayez Habach, Mykolas Mačiulis, Lukas Kontenis, Saulius Bagdonas, Serguei Krouglov, Vytautas Baranauskas, Danutė Bulotienė, Vitalijus Karabanovas, Ričardas Rotomskis, Margarete K. Akens, Virginijus Barzda

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced Fluorescence Microscopy Techniques
Établissements canadiensUniversity Health NetworkUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaEuropean Regional Development FundLietuvos Mokslo Taryba
Mots-clésSecond-harmonic generationMicroscopyOptical microscopePolarimetryMaterials sciencePolarization (electrochemistry)Polarized light microscopyOpticsChemistryScanning electron microscopePhysicsScattering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Polarimetric second harmonic generation (SHG) microscopy is employed to study partially oriented fibrillar structures. The polarimetric SHG parameters are influenced by three-dimensional (3D) configuration of C 6 symmetry fibrilar structures in the focal volume (voxel) of a microscope. The achiral and chiral susceptibility tensor components ratios (R and C, respectively) are extracted from the linear polarization-in polarization-out (PIPO) measurements. The analytical derivations along with the polarimetric SHG microscopy results obtained from rat tail tendon, rabbit cornea, pig cartilage and meso-tetra (4-sulfonatophenyl) porphine (TPPS 4 ) cylindrical aggregates demonstrate that SHG intensity is affected by parallel/antiparallel arrangements of the fibers, and R and C ratio values change by tilting the fibers out of image plane, as well as by crossing the fibers in 2D and 3D. The polarimetric microscopy results are consistent with the digital microscopy modeling of fibrillar structures. These results facilitate the interpretation of polarimetric SHG microscopy images in terms of 3D organization of fibrilar structures in each voxel of the samples. Statement of Significance Polarimetric second harmonic generation (SHG) microscopy is used to study partially oriented C 6 symmetry chiral fibrillar structures. The linear polarization-in polarization-out (PIPO) SHG imaging is performed on rat tail tendon, rabbit cornea, pig cartilage tissues and meso-tetra (4-sulfonatophenyl) porphine (TPPS 4 ) cylindrical aggregates. The study demonstrates that SHG intensity is affected by parallel/antiparallel arrangements of the fibers, and the achiral and chiral susceptibility component ratio values change by tilting the fibers out of image plane, as well as by crossing the fibers in 2D and 3D. The polarimetric microscopy results are consistent with the digital microscopy modeling of fibrillar structures. These results facilitate the interpretation of polarimetric SHG microscopy images in terms of 3D organization of fibrillar structures in each voxel of the samples.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,087
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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