POPULATION GENETIC STRUCTURE OF TWO CRYPTIC DUCKWEED SPECIES (Lemna minor & L. turionifera) IN ALBERTA USING A GENOTYPING-BY-SEQUENCING APPROACH
Notice bibliographique
Résumé
Identifying the population genetic structure is important for the development of species-specific management plans. Investigating the population genetics of cryptic species is even more critical. Here we focus on two cryptic duckweed species, Lemna minor L. and L. turionifera Landolt, which have overlapping ranges in our study region of Alberta, Canada, and elsewhere, and are easily mistaken for one another. We used genotyping-by-sequencing to determine the population genetic structure of both duckweed species. A total of 192 samples were sequenced and after filtering, >16,000 SNP were used to examine patterns of genetic diversity between and within L. minor and L. turionifera. The two species showed clear differentiation. When examining L. turionifera singly, we found no evidence of genetically distinct populations among 67 samples from 43 sites. In contrast, when examining L. minor singly, we discovered at least three genetically distinct populations among the 30 samples from eight sites, even though these were from a small geographic area. We also examined the relationship between surface water quality variables and the distribution of the two Lemna species. The sites containing L. turionifera had a wider range of water chemistry variables suggesting they are more tolerant of different environmental conditions. In contrast, each of the three genetically distinct L. minor groups had different water chemistry profiles. Large differences between L. minor and L. turionifera in their regional distributions and degrees of genetic differentiation highlight the importance of documentation and careful monitoring of Lemna species within Alberta, and in other regions where they co-occur.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».