Seasons Influence the Native Gut Microbiome of Lake Trout Salvelinus namaycush
Notice bibliographique
Résumé
The fish gut microbiome plays an essential role in the host’s development and survival. Environmental factors can shape the gut microbiome and potentially mediate physiological performance. Seasonal environments that experience regular abiotic and biotic transitions likely drive variability in the gut microbiome. However, we know very little about how seasonal transitions interact with the gut microbiome, especially at northern latitudes where seasonality is exaggerated. Therefore, in this study, we analyzed the native gut microbiome of a flexible top predator fish species, the lake trout, across seasons in a boreal lake using 16S rRNA sequencing. Seasonal changes explained one third of the bacterial variance. The relative abundance of several bacterial taxa influenced the observed seasonal differences in the community; pathogenic Pseudomonas and Stenotrophomonas were most abundant in the spring and winter seasons, and chemoheterotrophic Macrococcus and Lelliottia were most abundant in the summer. The fall season was dominated by unclassified Clostridiaceae, potentially linked to a shift in lake trout foraging. Therefore, we present novel evidence that suggests seasonality is likely to shape the native gut microbiome of lake trout; however, the mechanistic links between the environment and the microbial diversity of the gut remain to be uncovered.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,007 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».