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Enregistrement W4322201496 · doi:10.1101/2023.02.24.23286387

Detection and clearance of type-specific and phylogenetically related genital human papillomavirus infections in young women in new heterosexual relationships

2023· preprint· en· W4322201496 sur OpenAlexafffund
Andrew Arthur, Mariam El‐Zein, Ann N. Burchell, Pierre‐Paul Tellier, François Coutlée, Eduardo L. Franco

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCervical Cancer and HPV Research
Établissements canadiensSt. Michael's HospitalCentre Hospitalier de l’Université de MontréalMcGill University
Organismes subventionnairesUniversité de MontréalMcGill University
Mots-clésHuman papillomavirusSex organVirologyBiologyMedicineInternal medicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Understanding the natural history of human papillomavirus (HPV) infections is essential to effective cervical cancer prevention planning. We examined these outcomes in-depth among young women. Methods: The HPV Infection and Transmission among Couples through Heterosexual Activity (HITCH) study is a prospective cohort of 501 college-age women who recently initiated a heterosexual relationship. We tested vaginal samples collected at six clinical visits over 24 months for 36 HPV types. Using rates and Kaplan-Meier analysis, we estimated time-to-event statistics with 95% confidence intervals (CIs) for detection of incident infections and liberal clearance of incident and present-at-baseline infections (separately). We conducted analyses at the woman- and HPV-levels, with HPV types grouped by phylogenetic relatedness. Results: By 24 months, we detected incident infections in 40.4%, CI:33.4-48.4 of women. Incident subgenus 1 (43.4, CI:33.6-56.4), 2 (47.1, CI:39.9-55.5) and 3 (46.6, CI:37.7-57.7) infections cleared at similar rates per 1000 infection-months. We observed similar homogeny in HPV-level clearance rates among present-at-baseline infections. Conclusions: Our woman-level analyses of infection detection and clearance agreed with similar studies. However, our HPV-level analyses did not clearly indicate that high oncogenic risk subgenus 2 infections take longer to clear than their low oncogenic risk and commensal subgenera 1 and 3 counterparts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,083
Tête enseignante GPT0,335
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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