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Enregistrement W4322212953 · doi:10.14740/wjon1571

The Impact of DTYMK as a Prognostic Marker in Colorectal Cancer

2023· article· en· W4322212953 sur OpenAlexvenueno aff
Abdulaziz A. Aloliqi, Abdulfattah Fararjeh, Ali Al Khader, Ezidin G. Kaddumi, Alaa Abdulaziz Eisa, Weam Jaradat

Notice bibliographique

RevueWorld Journal of Oncology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHistone Deacetylase Inhibitors Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineColorectal cancerTissue microarrayImmunohistochemistryBiomarkerMSH2Internal medicineOncologyClinical significanceHepatocellular carcinomaStage (stratigraphy)MSH6AdenocarcinomaLung cancerCancerPathologicalPathologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Overexpression of deoxythymidylate kinase (DTYMK) has been associated with more aggressiveness and pathological behaviors in hepatocellular carcinoma (HCC) and non-small cell lung cancer (NSCLC). However, the expression of DTYMK and its prognostic significance in colorectal cancer (CRC) patients are yet unknown. The goal of this study was to investigate the DTYMK immunohistochemistry reactivity in CRC tissues and to see how it correlated with various histological and clinical features as well as survival. Methods: Several bioinformatics databases and two tissue microarrays (TMAs) of 227 cases were used in this study. Immunohistochemistry assay was used to study the protein expression of DTYMK. Results: Based on the GEPIA, UALCAN, and Oncomine databases, DTYMK expression has increased in tumor tissues at both RNA and protein levels in colorectal adenocarcinoma (COAD) compared to normal tissues. A high DTYMK H-score was found in 122/227 (53%) of the cases, whereas a low DTYMK H-score was found in 105/227. The age at diagnosis (P = 0.036), stage of the disease (P = 0.038), and site of origin (P = 0.032) were all linked to a high DTYMK H-score. Patients with high level of DTYMK had bad overall survival. Interestingly, high DTYMK protein level was associated with PSM2 (P = 0.002) and MSH2 (P = 0.003), but not with MLH2 or MSH6. Conclusion: This is the first study to cover the expression and prognostic significance of DTYMK in CRC. DTYMK was upregulated in CRC and could be considered as a prognostic biomarker.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,381
Écart entre enseignants0,365 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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