Evaluation of the ID NOW among symptomatic individuals during the Omicron wave
Notice bibliographique
Résumé
Introduction. Starting in December, 2020, the ID NOW was implemented throughout the province of Alberta, Canada (population 4.4 million) in various settings. Gap statement. ID NOW’s test performance with SARS-CoV-2 Omicron variant BA.1 is unknown. Aim. To assess the ID NOW performance among symptomatic individuals during the BA.1 Omicron wave and compare it to previous SARS-CoV-2 variant waves. Methodology. The ID NOW was assessed in two locations among symptomatic individuals: rural hospitals and community assessment centres (AC) during the period 5–18 January 2022. Starting 5 January, Omicron represented >95 % of variants detected in our population. For every individual tested, two swabs were collected: one for ID NOW testing and the other for either reverse-transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) confirmation of negative ID NOW results or for variant testing of positive ID NOW results. Results. A total of 3041 paired samples were analysed (1139 RT-PCR positive). From this, 1873 samples were from 42 COVID-19 AC and 1168 from 69 rural hospitals. ID NOW sensitivity for symptomatic individuals presenting to community AC and rural hospitals was 96.0 % [95 % confidence interval (CI) 94.5–97.3 %, n =830 RT-PCR positive], and 91.6 % (95 % CI 87.9–94.4 %, n =309 RT-PCR positive), respectively. SARS-CoV-2 positivity rate was very high for both populations (44.3 % at AC, 26.5 % in hospital). Conclusions. Sensitivity of ID NOW SARS-CoV-2, compared to RT-PCR, is very high during the BA.1 Omicron wave, and is significantly higher when compared to previous SARS-CoV-2 variant waves.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,006 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».