MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4322492732 · doi:10.3897/neobiota.82.97881

Genetic relationships among laboratory lines of the egg parasitoid Trissolcus japonicus from native and adventive populations

2023· article· en· W4322492732 sur OpenAlexafffundabout
Paul K. Abram, Tyler D. Nelson, Valerie Marshall, Tara D. Gariépy, Tim Haye, Jinping Zhang, Tracy Hueppelsheuser, Susanna Acheampong, Chandra E. Moffat

Notice bibliographique

RevueNeoBiota · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueHemiptera Insect Studies
Établissements canadiensMinistry of AgricultureGovernment of British ColumbiaAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of AlbertaWashington State University
Mots-clésBiologyInvasive speciesIntroduced speciesEcologyPentatomidaeBiological pest controlRange (aeronautics)ScelionidaeGenetic diversityGenetic variationParasitoidPopulationHemipteraDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Candidate biological control agents of invasive insect pests are increasingly being found in new geographic regions as a result of unintentional introductions. However, testing the degree of genetic differentiation among adventive and native-range populations of these agents is rarely done. We used reduced-representation sequencing of genomic DNA to investigate the relationships among laboratory lines of Trissolcus japonicus (Ashmead) (Hymenoptera, Scelionidae), an egg parasitoid and biological control agent of the brown marmorated stink bug, Halyomorpha halys (Stål) (Hemiptera, Pentatomidae). We compared sequences from multiple adventive populations in North America (Canada, USA) and Europe (Switzerland) with populations sourced from part of its native range in China. We found considerably more genetic variation among lines sourced from adventive populations than among those within native populations. In the Pacific Northwest of North America (British Columbia, Canada and Washington State, USA), we found preliminary evidence of three distinct genetic clusters, two of which were highly dissimilar from all other lines we genotyped. In contrast, we found that other adventive lines with close geographic proximity (two from Ontario, Canada, three from Switzerland) had limited genetic variation. These findings provide a basis for testing biological differences among lines that will inform their use as biological control agents, and provide evidence to support a hypothesis of several independent introductions of T. japonicus in western North America from different source areas.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,027
Score d'incertitude au seuil0,054

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission3
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNeoBiotaMême sujetHemiptera Insect StudiesTravaux en français237 207