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Enregistrement W4322496512 · doi:10.1089/vbz.2022.0040

A Method to Create Directed Acyclic Graphs from Cycles of Transmission of Zoonotic and Vector-Borne Infectious Agents

2023· review· en· W4322496512 sur OpenAlexaff
Ellen Jackson, Amanda E. Janitz, Hélène Carabin

Notice bibliographique

RevueVector-Borne and Zoonotic Diseases · 2023
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMosquito-borne diseases and control
Établissements canadiensUniversité de MontréalCentre Intégré Universitaire de Santé et de Services Sociaux du Centre-Sud-de-l'Île-de-Montréal
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésDirected acyclic graphTransmission (telecommunications)ConfoundingVector (molecular biology)Computer scienceBiologyMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: The life cycles of zoonotic and vector-borne diseases can be complex. This complexity makes it challenging to identify factors that confound the association between an exposure of interest and infection in one of the susceptible hosts. In epidemiology, directed acyclic graphs (DAGs) can be used to visualize the relationships between exposures and outcomes and also to identify which factors confound the association between exposure and the outcome of interest. However, DAGs can only be used in situations where no cycle exists in the causal relationships being represented. This is problematic for infectious agents that cycle between hosts. Zoonoses and vector-borne diseases pose additional challenges with DAG construction since multiple required or optional hosts of different species may be part of the cycle. Methods: We review the existing examples of DAGs created for nonzoonotic infectious agents. We then demonstrate how to cut the transmission cycle to create DAGs where infection of a specific host species is the outcome of interest. We adapt our method to create DAGs using examples of transmission and host characteristics common to many zoonotic and vector-borne infectious agents. Results: We demonstrate our method using the transmission cycle of West Nile virus to create a simple transmission DAG that lacks a cycle. Conclusions: Using our work, investigators can create DAGs to help identify confounders of the relationships between modifiable risk factors and infection. Ultimately, a better understanding and control of confounding in measuring the impact of such risk factors can be used to inform health policy, guide public health and animal health interventions, and uncover gaps needing further research attention.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,958
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,334
Écart entre enseignants0,302 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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