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Enregistrement W4322616560 · doi:10.1172/jci163239

Epsilon toxin–producing Clostridium perfringens colonize the multiple sclerosis gut microbiome overcoming CNS immune privilege

2023· article· en· W4322616560 sur OpenAlexafffund
Yinghua Ma, David R. Sannino, Jennifer R. Linden, Sylvia Haigh, Baohua Zhao, John B. Grigg, Paul Zumbo, Friederike Dündar, Daniel Butler, Caterina P. Profaci, Kiel M. Telesford, Paige Winokur, Kareem Rashid Rumah, Susan A. Gauthier, Vincent A. Fischetti, Bruce A. McClane, Francisco A. Uzal, Lily Zexter, Michael Mazzucco, Richard A. Rudick, David Danko, Evan A. Balmuth, Nancy Nealon, Jai Perumal, Ulrike W. Kaunzner, Ilana Brito, Zhengming Chen, Jenny Xiang, Doron Betel, Richard Daneman, Gregory F. Sonnenberg, Christopher E. Mason, Timothy Vartanian

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Investigation · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueClostridium difficile and Clostridium perfringens research
Établissements canadiensHatch (Canada)
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of General Medical SciencesNational Institute of Mental HealthNational Institutes of HealthYork UniversityMultiple Sclerosis SocietyWeill Cornell Medical CollegeNational Multiple Sclerosis Society
Mots-clésClostridium perfringensMicrobiologyImmune systemMicrobiomeBiologyMultiple sclerosisGut microbiomeToxinMicrobial toxinsImmunologyBacteriaBioinformaticsGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Multiple sclerosis (MS) is a complex disease of the CNS thought to require an environmental trigger. Gut dysbiosis is common in MS, but specific causative species are unknown. To address this knowledge gap, we used sensitive and quantitative PCR detection to show that people with MS were more likely to harbor and show a greater abundance of epsilon toxin-producing (ETX-producing) strains of C. perfringens within their gut microbiomes compared with individuals who are healthy controls (HCs). Isolates derived from patients with MS produced functional ETX and had a genetic architecture typical of highly conjugative plasmids. In the active immunization model of experimental autoimmune encephalomyelitis (EAE), where pertussis toxin (PTX) is used to overcome CNS immune privilege, ETX can substitute for PTX. In contrast to PTX-induced EAE, where inflammatory demyelination is largely restricted to the spinal cord, ETX-induced EAE caused demyelination in the corpus callosum, thalamus, cerebellum, brainstem, and spinal cord, more akin to the neuroanatomical lesion distribution seen in MS. CNS endothelial cell transcriptional profiles revealed ETX-induced genes that are known to play a role in overcoming CNS immune privilege. Together, these findings suggest that ETX-producing C. perfringens strains are biologically plausible pathogens in MS that trigger inflammatory demyelination in the context of circulating myelin autoreactive lymphocytes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,011
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,415
Score d'incertitude au seuil0,997

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,011
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,165
Tête enseignante GPT0,375
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations48
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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