Genetic variety of ORF3a shapes SARS‐CoV‐2 fitness through modulation of lipid droplet
Notice bibliographique
Résumé
Severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 (SARS-CoV-2) infection leads to the accumulation of lipid droplets (LD), the central hubs of the lipid metabolism, in vitro or in type II pneumocytes and monocytes from coronavirus disease 19 (COVID-19) patients and blockage of LD formation by specific inhibitors impedes SARS-CoV-2 replication. Here, we showed that ORF3a is necessary and sufficient to trigger LD accumulation during SARS-CoV-2 infection, leading to efficient virus replication. Although highly mutated during evolution, ORF3a-mediated LD modulation is conserved in most SARS-CoV-2 variants except the Beta strain and is a major difference between SARS-CoV and SARS-CoV-2 that depends on the genetic variations on the amino acid position 171, 193, and 219 of ORF3a. Importantly, T223I substitution in recent Omicron strains (BA.2-BF.8) impairs ORF3a-Vps39 association and LD accumulation, leading to less efficient replication and potentially contributing to lower pathogenesis of the Omicron strains. Our work characterized how SARS-CoV-2 modulates cellular lipid homeostasis to benefit its replication during virus evolution, making ORF3a-LD axis a promising drug target for the treatment of COVID-19.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».