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Enregistrement W4322774420 · doi:10.1002/ima.22868

Prediction of drug amount in Parkinson's disease using hybrid machine learning systems and radiomics features

2023· article· en· W4322774420 sur OpenAlexafffund
Mohammad R. Salmanpour, Mahdi Hosseinzadeh, Mahya Bakhtiyari, Mehdi Maghsudi, Arman Rahmim

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Imaging Systems and Technology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiomics and Machine Learning in Medical Imaging
Établissements canadiensTeck (Canada)University of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésLevodopaComputer scienceFeature selectionArtificial intelligenceFeature (linguistics)Machine learningParkinson's diseaseMedicineDiseaseInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Parkinson's disease (PD) is progressive and heterogeneous. Levodopa is widely prescribed to control PD, and its long‐term‐treatment leads to dyskinesia in a dose‐dependent manner. Interpretation of clinical trials comparing different drug treatments for PD is complicated by different dose intensities employed: higher doses of levodopa produce better symptomatic control but more late complications. Thus, the dose must be recalibrated and reduced gradually. Since recommendations for gradually reducing Levodopa are currently lacking and estimation of Levodopa amount can help doctor to correctly prescribe drug amount, this study aims to predict Levodopa amount and incremental doses using Hybrid Machine Learning Systems (HMLS) and a mixture of radiomics and clinical features. We selected 264 patients from PPMI and obtained 950 features including imaging and nominating features. We generated seven datasets constructed from the dataset in years 0 and 1, which linked with outcomes, (O1) patients being on/off drug in year 1, (O2) dose amount in year 1, and (O3‐8) incremental dose from 1st to 2nd, 2nd to 3rd, 3rd to 4th, 4th to 5th, 1st to 4th, 1st to 5th year. HMLSs included 10 feature extraction/9 feature selection algorithms followed by 10 prediction algorithms. To predict O1, timeless dataset + Random Forest + ReliefA had the highest accuracy~88.5% ± 2.2%, and external testing~91.6%. Furthermore, to predict O2, timeless dataset + Minimum Redundancy Maximum Relevance Algorithm (MRMR) + K Nearest Neighbor Regressor (KNN‐R) achieved a mean absolute error (MAE) ~ 47.5 ± 13.6 ([30.3:850 milligram]) and external testing~31.9. To predict dose increments (O3‐8), HMLSs: Unsupervised Feature Selection with Ordinal Locality + KNNR, ReliefA + KNNR, ReliefA + KNNR, Local Learning‐based Clustering Feature Selection + KNNR, MRMR + KNNR, and MRMR + KNNR applied to timeless datasets resulted in MAEs ~ 0.42 ± 0.18, 0.10 ± 0.09, 0.04 ± 0.01, 0.24 ± 0.15, 0.25 ± 0.05, and 0.33 ± 0.26 ([0.23:29.7]), respectively. Moreover, their external testing confirmed our findings. We demonstrated that timeless datasets including a mixture of clinical and imaging features, linked with appropriate HMLSs, significantly improve prediction performances.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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