Target gene selection for <scp>RNAi</scp>‐based biopesticides against the hawthorn spider mite, <i>Amphitetranychus viennensis</i> (Acari: Tetranychidae)
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Recently, RNA interference (RNAi)-based biopesticide, a species-specific pest control alternative, has been deregulated and commercialized in the US and Canada. The hawthorn spider mite, Amphitetranychus viennensis Zacher, is a major pest for rosaceous plants, which has been controlled primarily by synthetic pesticides. To address the emerging resistance issues in A. viennensis, we initiated a project to develop RNAi-based biopesticides. RESULTS: In this study, we (i) developed a dietary RNAi system for A. viennensis using leaf disc, (ii) assessed the suitability of multiple control genes to distinguish sequence-specific silencing from non-specific effects within this RNAi system, and (iii) screened for the target gene candidates. As a result, β-Glucuronidase (GUS), an enzyme derived from E. coli and a broadly used reporter for plants is the appropriate control for A. viennensis RNAi, while green fluorescent protein (GFP), is not suitable due to its significantly higher mortality than the other controls. For target gene screening, suppression was confirmed for all the candidates, including two housekeeping genes (Vacuolar-type H + -ATPase subunit A (V-ATPase A) and Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase, (GAPDH)), and three genes associated with development (ATP-dependent RNA Helicase DDX3Y (Belle), CREB-binding protein (CBP), and Farnesoic acid O-methyltransferase (FaMet)). Knocking down of V-ATPase A resulted in the highest mortality (~ 90%) and reduced fecundity (over 90%) than other candidates. As for the genes associated with development, suppression of Belle and CBP, led to approximately 65% mortality, as well as 86% and 40% reduction in fecundity, respectively. Silencing of FaMet, however, had negligible biological impacts on A. viennensis. CONCLUSION: The combined efforts not only establish an effective dsRNA delivery method, but also provide potential target genes for RNAi-based biopesticides against A. viennensis, a devastating invasive pest for fruit trees and woody ornamental plants throughout Asia and Europe. © 2023 Society of Chemical Industry.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».