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Enregistrement W4323306380 · doi:10.1117/12.2649217

Application of Raman spectroscopy and multivariate analysis to detect ionizing radiation-induced changes in blood plasma

2023· article· en· W4323306380 sur OpenAlexaff
Amiel Beausoleil-Morrison, Connor McNairn, Xiaoke Qin, Cristian Ciobanu, Kaitlyn Altwasser, Sanjeena Subedi, Vinita Chauhan, Sangeeta Murugkar

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSpectroscopy Techniques in Biomedical and Chemical Research
Établissements canadiensHealth CanadaMcGill UniversityCarleton University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiodosimetryRaman spectroscopyDicentric chromosomeIonizing radiationIrradiationNuclear medicineMedicineMaterials scienceChemistryOpticsPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The risk of large-scale radiological/nuclear events has notably increased in recent years. Biodosimetry is considered an essential tool for emergency management following such unplanned exposures to ionizing radiation. For example, by assessing an individual’s received dose to blood, biodosimetry can support medical screening and individual health management. Current biodosimetry techniques, such as the dicentric chromosome assay, are based on the analysis of chromosomal aberrations Although highly accurate, these methods are time-consuming and labour-intensive. We recently developed a new high-throughput approach based on Raman spectroscopy of blood combined with covariate-adjusted multivariate analysis for the detection of irradiated blood. We found that the protein bands in the Raman spectra were the main sources of discrimination between unirradiated (control) and irradiated blood. In this follow up work, we explored the application of Raman spectroscopy and multivariate analysis to blood plasma to avoid dominant hemoglobin contributions. Peripheral blood drawn from a healthy volunteer was irradiated at 0 (control), 5 and 20 Gy using 250 kV X-rays. After a 4 hour incubation time, plasma centrifuged from the blood sample was immediately frozen at -80 deg C. Raman measurements were performed in triplicate on thawed blood plasma samples. Partial least squares-discriminant analysis (PLS-DA) was utilized for multi-class differentiation between Raman spectra of 0, 5 and 20 Gy irradiated plasma. Sparse PLS-DA (sPLS-DA) provided improved dose classification after combining Raman spectral data from different batches. Biomarker information related to radiation-induced changes in blood plasma was also extracted from sPLS-DA. The outcomes of these initial studies highlight the value of Raman spectroscopy to support biodosimetry.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,327
Écart entre enseignants0,315 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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