Parallel Dysregulated Immune Response in Severe Forms of COVID-19 and Bacterial Sepsis via Single-Cell Transcriptome Sequencing
Notice bibliographique
Résumé
Critically ill COVID-19 patients start developing single respiratory organ failure that often evolves into multiorgan failure. Understanding the immune mechanisms in severe forms of an infectious disease (either critical COVID-19 or bacterial septic shock) would help to achieve a better understanding of the patient's clinical trajectories and the success of potential therapies. We hypothesized that a dysregulated immune response manifested by the abnormal activation of innate and adaptive immunity might be present depending on the severity of the clinical presentation in both COVID-19 and bacterial sepsis. We found that critically ill COVID-19 patients demonstrated a different clinical endotype that resulted in an inflammatory dysregulation in mild forms of the disease. Mild cases (COVID-19 and bacterial non severe sepsis) showed significant differences in the expression levels of CD8 naïve T cells, CD4 naïve T cells, and CD4 memory T cells. On the other hand, in the severe forms of infection (critical COVID-19 and bacterial septic shock), patients shared immune patterns with upregulated single-cell transcriptome sequencing at the following levels: B cells, monocyte classical, CD4 and CD8 naïve T cells, and natural killers. In conclusion, we identified significant gene expression differences according to the etiology of the infection (COVID-19 or bacterial sepsis) in the mild forms; however, in the severe forms (critical COVID-19 and bacterial septic shock), patients tended to share some of the same immune profiles related to adaptive and innate immune response. Severe forms of the infections were similar independent of the etiology. Our findings might promote the implementation of co-adjuvant therapies and interventions to avoid the development of severe forms of disease that are associated with high mortality rates worldwide.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».