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Enregistrement W4323350507 · doi:10.1101/2023.03.06.531358

Knockout of endoplasmic reticulum localized molecular chaperone HSP90.7 impairs seeding development and cellular auxin homeostasis in Arabidopsis

2023· preprint· en· W4323350507 sur OpenAlexafffund
Jenan Noureddine, Bona Mu, Homaira Hamidzada, Wai Lam Mok, Diana Bonea, Eiji Nambara, Rongmin Zhao

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHeat shock proteins research
Établissements canadiensThe Scarborough HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesUniversity of TorontoUniversity of Toronto ScarboroughInstitute of Science and Technology Austria
Mots-clésArabidopsisAuxinCell biologyBiologyEndoplasmic reticulumMeristemHsp90MutantHeat shock proteinGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SUMMARY The Arabidopsis endoplasmic reticulum localized heat shock protein HSP90.7 modulates tissue differentiation and stress responses; however, complete knockout lines have not been previously reported. In this study, we identified and analyzed a mutant allele, hsp90.7-1 , which did not express any protein and showed seedling lethality. Microscopic analyses revealed its essential role in male and female fertility, trichomes and root hairs development, proper chloroplast function, and in apical meristem maintenance and differentiation. Comparative transcriptome and proteome analyses also revealed a role of the protein in a multitude of cellular processes. Particularly, the auxin responsive pathway was specifically down-regulated in the hsp90.7-1 mutant seedlings. We measured a much-reduced auxin content in both root and shoot tissues. Through comprehensive histological and molecular analyses, we demonstrated PIN1 and PIN5 expressions were dramatically reduced in the mutant, and the TAA-YUCCA primary auxin biosynthesis pathway was also down-regulated, thus revealing a critical new role of HSP90.7 in the regulation of auxin responses. This study therefore not only fulfilled a gap in understanding the essential role of HSP90 paralogs in eukaryotes, but also provided a mechanistic insight on this molecular chaperone in regulating plant growth and development via modulating cellular auxin homeostasis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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