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Enregistrement W4323350623 · doi:10.1093/jcag/gwac036.273

A273 INCREASING THE REPRESENTATION OF INDIANS IN MICROBIOME RESEARCH: HOW DOES THEIR GUT MICROBIOME DIFFER?

2023· article· en· W4323350623 sur OpenAlexaffabout
L D D'Aloisio, C.J. McComb, Vignesh Shetty, Mamatha Ballal, Sanjoy Ghosh, D L Gibson

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensUniversity of British Columbia, Okanagan CampusUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMicrobiomeGut microbiomeDiseasePopulationInflammatory bowel diseaseEtiologyImmunologyBiologyMedicineBioinformaticsEnvironmental healthPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background During the 1900s when industrialization was on the rise in western countries, inflammatory bowel disease (IBD) began to present itself and continually increase over the decades. Now, newly industrialized countries such as India are following this same pattern, and with a population reaching over one billion, India is projected to have one of the highest IBD prevalence worldwide. Furthermore, pediatric diagnoses of IBD are more frequently reported in India and in Indian children living in Canada, suggesting this disease may present differently in those of Indian descent. While the etiology of IBD remains unclear, a gut microbiome that is no longer symbiotic with its host is a key player. However, Indians are one of the least represented in microbiome research, therefore we cannot accurately assess the role of their gut microbiome in IBD. To effectively understand the nature of IBD in Indians, we must first define their gut microbiome. Purpose Our study characterizes the microbiome of Indians living in India to explore how it differs from Canadians of European descent. Method Stool samples from healthy volunteers (ages 18-55) were collected from Indians in India and Euro-Canadians in Kelowna, BC. Microbial DNA was extracted for 16S sequencing on the Illumina MiSeq platform and QIIME2 was used for microbiome analysis. Result(s) We will discuss the similarities and differences comparing the gut microbiome of Indians to Euro-Canadians, further highlighting the need for more microbiome research of this demographic. Conclusion(s) Our research aims to increase representation of Indians in microbiome research in the hopes of improving our knowledge of the predispositions to IBD, which will aid in the information required to develop effective preventive measures. With elevated risk for IBD in Indians residing in Canada, future studies should also aim to analyze if the gut microbiome in Indians change as they migrate and adopt the westernized lifestyle. Disclosure of Interest None Declared

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,129
Score d'incertitude au seuil0,257

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0030,002
Communication savante0,0030,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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