A274 THE EFFECT OF DIETARY MODULATION ON FUNGAL AND VIRAL COMMUNITIES IN THE GASTROINTESTINAL TRACT: A LITERATURE REVIEW
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background The human gut microbiome is a complex, dynamic community that has been shown to impact gastrointestinal (GI) diseases, including inflammatory bowel disease (IBD). Particularly, changes in diet quality and composition can influence the composition and function of the gut microbiome, leading to an inappropriate response to inflammation, increasing risk for IBD flare. Currently, our understanding of diet modulation largely revolves around changes in bacterial composition and diversity, despite our knowledge of neighbouring eukaryotes, viruses, and archaea within the GI tract. This literature review serves to bolster our understanding of diet modulation on viral and fungal communities, in an effort to support non-pharmacological therapies in IBD. Purpose To assess current literature investigating the effect of diet modulation on the gut microbiota, with interest in viral and fungal communities. Method We performed a MEDLINE and EMBASE literature review with the following search terms: "microbiome / microbiota / microbe" and "fungi / fungal" or "virus / viral / virome" and "diet composition" or "high fiber/re diet" or "diet therapy" or "diet." Exclusion criteria: - Abstracts - Articles not in English - Expert Review articles - Articles investigating bacterial microbiota communities exclusively Result(s) Our EMBASE and MEDLINE search identified 418 and 343 articles, respectively. After applying our exclusion criteria and removing duplicates, 13 articles were included (5 - fungal communities exclusively, 4 - viral communities exclusively, 4 - both). Novel research directly investigating the impact of diet modulation on fungal and viral communities in the gut microbiota are exceedingly rare. Despite this, both communities in animal and human models showed increases in diversity in response to diet modulation, independent of changes in bacterial composition. Fungal communities in animal studies showed a four-fold increase in diversity with changes in diet composition (standard chow to high-grain/ high fibre /low fat) as soon as 28 days post dietary commencement. In human studies, fungal communities changed in response to short term diet changes, not long-term. Candida was positively correlated with carbohydrate ingestion, while Aspergillus was negatively correlated with short chain fatty acid ingestion. Viral communities in animal models showed a similar increase in diversity in response to diet modulation (standard chow to high-grain/high-fibre). In human studies, virome response to diet increased most significantly in those with lower initial viral diversity. However, viral diversity was impacted most by interpersonal variation, not diet modulation. Conclusion(s) Diet modulation remains a key player in altering the gut microbiome, extending to fungal and viral communities. Further studies are required to elucidate the magnitude and temporal effect on these lesser studied microbial communities, given recent studies showing the importance of fungal/viral microbes in IBD. Please acknowledge all funding agencies by checking the applicable boxes below None Disclosure of Interest None Declared NEUROGASTROENTEROLOGY & MOTILITY
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,010 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,004 | 0,003 |
| Bibliométrie | 0,016 | 0,016 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,007 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».