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Enregistrement W4323353044 · doi:10.1093/jcag/gwac036.198

A198 THE LONG-TERM IMPACT OF ENVIRONMENTAL EXPOSURES ON HOST HEALTH AND THE RISK FACTORS OF CROHN'S DISEASE

2023· article· en· W4323353044 sur OpenAlexaff
M Xue, Williams Turpin, L. Ben Haim, S -H Lee, A Neustaeter, D Mei, Wei Xu, Osvaldo Espin‐Garcia, KL Madsen, David S. Guttman, A M Griffiths, H Huynh, Dan Turner, Remo Panancionne, H Steinhart, G Aumais, Alain Bitton, Kevan Jacobson, David R. Mack, Ken Croitoru

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensUniversity of OttawaUniversity of British ColumbiaHospital for Sick ChildrenUniversity of TorontoChildren's Hospital of Eastern OntarioMcGill UniversityUniversity of CalgaryUniversity of AlbertaLunenfeld-Tanenbaum Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSubclinical infectionDiseaseCrohn's diseaseMedicineFamily historyCalprotectinMedical historyInternal medicineProportional hazards modelHazard ratioIntestinal permeabilityInflammatory bowel disease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Several environmental factors are associated with Crohn’s disease (CD) in large case-control studies; however, it is not clear how these factors maybe be influenced by age of exposure and if they are related to alterations in pre-disease biological markers of CD risk. Purpose To investigate the association between environmental factors in different age groups with future risk of CD onset and assess their relation to other pre-disease biomarkers. Method We used an environmental risk assessment questionnaire (ERA) to collect information from healthy first-degree relatives(FDR) of CD enrolled in the CCC-GEM project. ERA was a multi-item questionnaire querying 69 questions under 7 section headings: background, cultural/ethnic, smoking history, medical history, family history, environmental history and pet history. For the environmental and pet sections, current and historical (<1, 2-4, 5-15 years old) data was captured at the time of recruitment. We used Cox proportional hazard models to identify exposures associated with future CD onset. Next, we used regression models to identify the relationship of exposures with biological factors associated with CD risk previously identified by our group i.e.: i) intestinal permeability using urinary fractional excretion of lactulose to mannitol ratio (LMR) with LMR≥0.025 defined as abnormal; ii) subclinical inflammation using fecal calprotectin (FCP) with FCP≥100µg/g; and iii) fecal microbiome composition and diversity using 16S rDNA sequencing. Two-sided p<0.05 (or false discovery rate corrected p<0.05) were considered significant. Result(s) A total of 4289 FDRs were recruited, 47% were male, median recruitment age was 17.0 years[6-35]. After a median follow-up of 5.6-years (IQR=3.42-8.67), 86 FDRs developed CD. Living with a dog between age 5-15 (Hazard Ratio (HR)=0.61; 95% confidence interval (CI)=0.39-0.95), and a large family size (>3) in the first year of life (HR=0.41; 95% CI=0.22-0.89) were protective against CD onset. Conversely, having a bird at time of survey (HR=2.84; CI=1.37-5.90), and having a sibling with CD (HR=2.07; 95% CI=1.18-3.63) were risk factors for CD onset. We found that owning a dog between age of 5-15 (Odd Ratio(OR)=0.77, 95% CI=0.65-0.90) was significantly associated with LMR, nine taxa bacterial and higher chao1 diversity index. Having a bird at time of survey was significantly associated with FCP (OR=2.04, 95% CI=1.33-3.11). There was no association between large family size and having a CD sibling with gut microbiome, FCP or LMR. Conclusion(s) The study identified four environmental factors associated with future development of CD. Among them, exposure to dogs during early life was protective against CD onset and might be explained by its association with normal gut permeability and microbiome. We also identified that having a bird at recruitment increased risk of CD onset which might be mediated by an increase in subclinical inflammation. Submitted on behalf of the CCC-GEM consortium Disclosure of Interest None Declared

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
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