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Enregistrement W4323353329 · doi:10.1093/jcag/gwac036.171

A171 INTESTINAL INTERFERON-LAMBDA RECEPTOR 1 EXPRESSION AND RESPONSES ARE SIGNIFICANTLY DECREASED IN PEDIATRIC INFLAMMATORY BOWEL DISEASE PATIENTS

2023· article· en· W4323353329 sur OpenAlexaffabout
Olamide Ogungbola, Ramsha Mahmood, Kevin J. Bittorf, N. Nguyen, Eytan Wine, D. Lorne Tyrrell, Heather Armstrong, Deanna M. Santer

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensUniversity of AlbertaUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInflammatory bowel diseaseImmunologyUlcerative colitisImmune systemInterferonInflammationAntibodyMedicineBiopsyBiologyPathologyDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background While interferon-lambdas (IFN-λs) were initially discovered for their role in antiviral immunity at mucosal barriers such as the lung and gut, there are many unanswered questions for how IFN-λs uniquely dampen inflammatory immune responses. In mouse colitis models, IFN-λs were shown to play a significant role in promoting epithelial barrier integrity and mucosal healing. Microbes present in the gut naturally induce IFN-λs, but how chronic inflammation, such as in patients with inflammatory bowel diseases (IBD), affects IFN-λ biology has not been well studied, especially in humans. Purpose Here, we tested the hypothesis that children with active, more severe IBD would present with lower intestinal IFN-λR levels and IFN-λ responses which could contribute to IBD pathology through exacerbated inflammation, decreased mucosal healing and impaired barrier function. Method We screened 14 novel antibodies to find the optimal clone that accurately stains the unique IFN-λ receptor subunit (IFN-λR1) protein in human intestinal tissue and IFN-λR1 levels were quantified by immunohistochemistry and flow cytometry in biopsy samples from children without IBD, Crohn’s disease, or ulcerative colitis (n=35 total). Fresh patient biopsies (ascending colon or terminal ileum) were also treated in media +/- IFN-λ for 24hrs using our novel ex vivo biopsy assay and changes in gene expression were quantified by RT-qPCR. Intestinal washes were also collected and microbes profiled by shotgun metagenomics. Result(s) We identified 2 new antibodies that accurately stained human cell lines and immune cells known to express IFN-λR1 protein (gut epithelial cells and B cells). We found that IFN-λ receptor (IFN-λR) levels are significantly reduced in gut epithelial and immune cells within pediatric IBD intestinal tissue, even at non-inflamed sites (p<0.01, 30-50% reduction) and this was even more pronounced when comparing moderate/severe disease compared to children with no disease activity. This led to lower IFN-λ responsiveness in IBD compared to non-IBD biopsies when investigating IFN-stimulated gene expression (p<0.05, up to 7-fold reduction). Paired patient gut microbe analyses identified specific species that correlated with changes in IFN-λ receptor expression. Conclusion(s) Together, our findings demonstrate pediatric IBD patients may be less able to induce critical IFN-λ-mediated antimicrobial responses and protective anti-inflammatory pathways. This work supports the goal to restore and promote IFN-λ responses as a novel therapeutic strategy for pediatric IBD. Please acknowledge all funding agencies by checking the applicable boxes below Other Please indicate your source of funding; Children's Hospital Research Institute of Manitoba Disclosure of Interest None Declared

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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