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Enregistrement W4323355392 · doi:10.26508/lsa.202201752

The TUDOR domain of SMN is an H3K79 <sup>me1</sup> histone mark reader

2023· article· en· W4323355392 sur OpenAlexafffund
Olivier Binda, Aimé Boris Kimenyi Ishimwe, Maxime Galloy, Karine Jacquet, Armelle Corpet, Amélie Fradet‐Turcotte, Jocelyn Côté, Patrick Lomonte

Notice bibliographique

RevueLife Science Alliance · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeurogenetic and Muscular Disorders Research
Établissements canadiensUniversité LavalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleCanadian Institutes of Health ResearchCentre National de la Recherche ScientifiqueUniversity of Ottawa
Mots-clésSpinal muscular atrophyBiologyHistoneHistone H3Histone H2AGeneticsCell biologyMolecular biologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Spinal muscular atrophy is the leading genetic cause of infant mortality and results from depleted levels of functional survival of motor neuron (SMN) protein by either deletion or mutation of the SMN1 gene. SMN is characterized by a central TUDOR domain, which mediates the association of SMN with arginine methylated (R me ) partners, such as coilin, fibrillarin, and RNA pol II (RNA polymerase II). Herein, we biochemically demonstrate that SMN also associates with histone H3 monomethylated on lysine 79 (H3K79 me1 ), defining SMN as not only the first protein known to associate with the H3K79 me1 histone modification but also the first histone mark reader to recognize both methylated arginine and lysine residues. Mutational analyzes provide evidence that SMN TUDOR associates with H3 via an aromatic cage. Importantly, most SMN TUDOR mutants found in spinal muscular atrophy patients fail to associate with H3K79 me1 .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,430
Score d'incertitude au seuil0,657

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,362
Écart entre enseignants0,315 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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