Community-based COVID-19 outbreak of the B.1.1.7 (Alpha) variant of concern in Newfoundland, February to March 2021
Notice bibliographique
Résumé
Background: From March 2020 to January 2021, Newfoundland and Labrador experienced 408 coronavirus disease 2019 (COVID-19) cases (incidence 78 per 100,000). In February and March 2021, a community outbreak of the B.1.1.7 (Alpha) variant occurred in the Eastern Regional Health Authority. This article describes the epidemiology of this variant of concern outbreak, identifies settings that likely contributed to spread and informs recommendations for public health measures (PHMs). Methods: Provincial surveillance data were linked with case interview data and a school class roster. Descriptive epidemiological methods were used to characterize the outbreak. Secondary attack rates (SAR) were calculated for households and classrooms. Results: This outbreak involved 577 laboratory-confirmed and 38 probable cases. Whole genome sequencing determined cases were B.1.1.7. The median age was 31 years and the highest proportion of cases were in the 15 to 19-year age group (29%); 293 (51%) were female and 140 (24%) were asymptomatic upon identification. Early cases were linked to a high school, sports activities, a restaurant and social gatherings. As the outbreak progressed, cases were associated with household transmission, a daycare, healthcare settings and a workplace. The unadjusted SAR estimate among laboratory-confirmed cases was 24.4% for households and 19.3% for classroom exposures. When adjusted for other potential exposures, SAR estimates were 19.9% for households and 11.3% for classrooms. Conclusion: This outbreak demonstrated how B.1.1.7 spread rapidly through a community with previously low COVID-19 transmission and few preventative PHMs in place. Implementation and compliance with school and community-based PHMs is critical for preventing transmission during outbreaks.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».