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Enregistrement W4323565347 · doi:10.3390/insects14030268

Native and Non-Native Bemisia tabaci NAFME Haplotypes Can Be Implicated in Dispersal of Endemic and Introduced Begomoviruses in Oman

2023· article· en· W4323565347 sur OpenAlexaff
Muhammad Shafiq Shahid, Jorge R. Paredes‐Montero, Muhammad Ashfaq, Abdullah M. Al‐Sadi, Judith K. Brown

Notice bibliographique

RevueInsects · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesSultan Qaboos University
Mots-clésBiologyBiological dispersalIntroduced speciesHaplotypeInvasive speciesEcologyGeneticsGenotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Irrigated agriculture and global trade expansion have facilitated diversification and spread of begomoviruses (Geminiviridae), transmitted by the Bemisia tabaci (Gennadius) cryptic species. Oman is situated on major crossroads between Africa and South Asia, where endemic/native and introduced/exotic begomoviruses occur in agroecosystems. The B. tabaci ‘B mitotype’ belongs to the North Africa–Middle East (NAFME) cryptic species, comprising at least eight endemic haplotypes, of which haplotypes 6 and/or 8 are recognized invasives. Prevalence and associations among native and exotic begomoviruses and NAFME haplotypes in Oman were investigated. Nine begomoviral species were identified from B. tabaci infesting crop or wild plant species, with 67% and 33% representing native and exotic species, respectively. Haplotypes 2, 3, and 5 represented 31%, 3%, and 66% of the B. tabaci population, respectively. Logistic regression and correspondence analyses predicted ‘strong’- and ‘close’ virus–vector associations involving haplotypes 5 and 2 and the exotic chili leaf curl virus (ChiLCV) and endemic tomato yellow leaf curl virus-OM, respectively. Patterns favor a hypothesis of relaxed virus–vector specificity between an endemic haplotype and the introduced ChiLCV, whereas the endemic co-evolved TYLCV-OM and haplotype 2 virus–vector relationship was reinforced. Thus, in Oman, at least one native haplotype can facilitate the spread of endemic and introduced begomoviruses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,870
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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