MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4323568707 · doi:10.3390/pathogens12030424

Coinfection of HPVs Is Associated with Advanced Stage in Colorectal Cancer Patients from Qatar

2023· article· en· W4323568707 sur OpenAlexaff
Queenie Fernandes, Ishita Gupta, Khaled Murshed, Hayan Abo Samra, Hamda Al-Thawadi, Semir Vranić, Mahir Petkar, Giridhara R. Babu, Ala‐Eddin Al Moustafa

Notice bibliographique

RevuePathogens · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCervical Cancer and HPV Research
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesQatar University
Mots-clésCoinfectionColorectal cancerMedicineInternal medicineOncologyCancerStage (stratigraphy)CohortPopulationHuman papillomavirusBreast cancerImmunologyVirusBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

High-risk human papillomaviruses (HPVs) are considered risk factors in the origin of several human malignancies, such as breast, cervical, head and neck, as well as colorectal cancers. However, there are no data reported on the HPV status in colorectal cancer in the State of Qatar. Therefore, we herein examined the presence of high-risk HPVs (16, 18, 31, 33, 35, 45, 51, 52, and 59), using polymerase chain reaction (PCR) in a cohort of 100 Qatari colorectal cancer patients, and their association with tumor phenotype. We found that high-risk HPV types 16, 18, 31, 35, 45, 51, 52, and 59 were present in 4, 36, 14, 5, 14, 6, 41, and 17% of our samples, respectively. Overall, 69 (69%) of the 100 samples were HPV positive; among these, 34/100 (34%) were positive for single HPV subtypes, while 35/100 (35%) of the samples were positive for two or more HPV subtypes. No significant association was noted between the presence of HPV and tumor grade, stage, or location. However, the presence of coinfection of HPV subtypes strongly correlated with advanced stage (stage 3 and 4) colorectal cancer, indicating that the copresence of more than one HPV subtype can significantly worsen the prognosis of colorectal cancer. The results from this study imply that coinfection with high-risk HPV subtypes is associated with the development of colorectal cancer in the Qatari population.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,318
Écart entre enseignants0,296 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePathogensMême sujetCervical Cancer and HPV ResearchTravaux en français237 207