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Enregistrement W4323652355 · doi:10.7554/elife.76300

A systematic assessment of preclinical multilaboratory studies and a comparison to single laboratory studies

2023· review· en· W4323652355 sur OpenAlexafffundabout
Victoria Hunniford, Agnes Grudniewicz, Dean Fergusson, Joshua Montroy, Emma Grigor, Casey Lansdell, Manoj M. Lalu

Notice bibliographique

RevueeLife · 2023
Typereview
Langueen
DomaineVeterinary
ThématiqueAnimal testing and alternatives
Établissements canadiensOttawa HospitalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesCanadian Anesthesiologists' SocietyGovernment of OntarioUniversity of OttawaCanadian Anesthesia Research Foundation
Mots-clésBiologyMedicineComputational biologyMedical physicsPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Multicentric approaches are widely used in clinical trials to assess the generalizability of findings, however, they are novel in laboratory-based experimentation. It is unclear how multilaboratory studies may differ in conduct and results from single lab studies. Here, we synthesized the characteristics of these studies and quantitatively compared their outcomes to those generated by single laboratory studies. Methods: MEDLINE and Embase were systematically searched. Screening and data extractions were completed in duplicate by independent reviewers. Multilaboratory studies investigating interventions using in vivo animal models were included. Study characteristics were extracted. Systematic searches were then performed to identify single lab studies matched by intervention and disease. Difference in standardized mean differences (DSMD) was then calculated across studies to assess differences in effect estimates based on study design (>0 indicates larger effects in single lab studies). Results: Sixteen multilaboratory studies met inclusion criteria and were matched to 100 single lab studies. The multicenter study design was applied across a diverse range of diseases, including stroke, traumatic brain injury, myocardial infarction, and diabetes. The median number of centers was four (range 2-6) and the median sample size was 111 (range 23-384) with rodents most frequently used. Multilaboratory studies adhered to practices that reduce the risk of bias significantly more often than single lab studies. Multilaboratory studies also demonstrated significantly smaller effect sizes than single lab studies (DSMD 0.72 [95% confidence interval 0.43-1]). Conclusions: Multilaboratory studies demonstrate trends that have been well recognized in clinical research (i.e. smaller treatment effects with multicentric evaluation and greater rigor in study design). This approach may provide a method to robustly assess interventions and the generalizability of findings between laboratories. Funding: uOttawa Junior Clinical Research Chair; The Ottawa Hospital Anesthesia Alternate Funds Association; Canadian Anesthesia Research Foundation; Government of Ontario Queen Elizabeth II Graduate Scholarship in Science and Technology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,335
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,630
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens large)
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,980
Score d'incertitude au seuil0,820

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,3350,630
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0040,003
Méta-épidémiologie (sens large)0,0200,022
Bibliométrie0,0510,028
Études des sciences et des technologies0,0020,005
Communication savante0,0080,009
Science ouverte0,0050,008
Intégrité de la recherche0,0050,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,715
Tête enseignante GPT0,629
Écart entre enseignants0,086 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeRevue systématique
DomaineMéthodes
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2023
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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