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Enregistrement W4323653269 · doi:10.2196/43988

Proposal of a Method for Transferring High-Quality Scientific Literature Data to Virtual Patient Cases Using Categorical Data Generated by Bernoulli-Distributed Random Values: Development and Prototypical Implementation

2023· article· en· W4323653269 sur OpenAlexvenueno aff
Christian Schmidt, Dorothea Kesztyüs, Martin Haag, Manfred Wilhelm, Tibor Kesztyüs

Notice bibliographique

RevueJMIR Medical Education · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueClinical Reasoning and Diagnostic Skills
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVirtual patientCategorical variableComputer scienceUSableNauseaMedicineMedical physicsPsychiatryMachine learningSurgery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Teaching medicine is a complex task because medical teachers are also involved in clinical practice and research and the availability of cases with rare diseases is very restricted. Automatic creation of virtual patient cases would be a great benefit, saving time and providing a wider choice of virtual patient cases for student training. OBJECTIVE: This study explored whether the medical literature provides usable quantifiable information on rare diseases. The study implemented a computerized method that simulates basic clinical patient cases utilizing probabilities of symptom occurrence for a disease. METHODS: Medical literature was searched for suitable rare diseases and the required information on the respective probabilities of specific symptoms. We developed a statistical script that delivers basic virtual patient cases with random symptom complexes generated by Bernoulli experiments, according to probabilities reported in the literature. The number of runs and thus the number of patient cases generated are arbitrary. RESULTS: We illustrated the function of our generator with the exemplary diagnosis "brain abscess" with the related symptoms "headache, mental status change, focal neurologic deficit, fever, seizure, nausea and vomiting, nuchal rigidity, and papilledema" and the respective probabilities from the literature. With a growing number of repetitions of the Bernoulli experiment, the relative frequencies of occurrence increasingly converged with the probabilities from the literature. For example, the relative frequency for headache after 10.000 repetitions was 0.7267 and, after rounding, equaled the mean value of the probability range of 0.73 reported in the literature. The same applied to the other symptoms. CONCLUSIONS: The medical literature provides specific information on characteristics of rare diseases that can be transferred to probabilities. The results of our computerized method suggest that automated creation of virtual patient cases based on these probabilities is possible. With additional information provided in the literature, an extension of the generator can be implemented in further research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,023
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,035

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,023
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,112
Tête enseignante GPT0,495
Écart entre enseignants0,383 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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