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Enregistrement W4323664508 · doi:10.1016/j.omtn.2023.03.001

Extracellular vesicle microRNA and protein cargo profiling in three clinical-grade stem cell products reveals key functional pathways

2023· article· en· W4323664508 sur OpenAlexafffund
Venkata Ramana Vaka, Sandrine Parent, Yousef Risha, Saad Khan, David W. Courtman, Duncan J. Stewart, Darryl R. Davis

Notice bibliographique

RevueMolecular Therapy — Nucleic Acids · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueExtracellular vesicles in disease
Établissements canadiensOttawa HospitalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMesenchymal stem cellCell biologyBiologymicroRNAMicrovesiclesStem cellExosomeCellExtracellular matrixCell typeStromal cellExtracellular vesicleCancer researchBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The cell origin-specific payloads within extracellular vesicles (EVs) mediate therapeutic bioactivity for a wide variety of stem cell types. In this study, we profiled the microRNA (miRNA) and protein cargos found within EVs produced by three clinical-grade stem cell products of different ontogenies being considered for clinical application, namely bone marrow-derived mesenchymal stromal cells (BM-MSCs), heart-derived cells (HDCs), and umbilical cord-derived MSCs (UC-MSCs). Although several miRNAs (757) and proteins (420) were found in common, each producer cell type expressed unique miRNA profiles when the most highly expressed transcripts were compared. Differential expression analysis revealed that BM-MSCs and HDCs were quite similar, while UC-MSCs had the greatest number of unique miRNAs and proteins. Despite these differences, all three EVs promoted cell adhesion/migration, immune response, platelet aggregation, protein translation/stabilization, and RNA processing. EVs from BM-MSCs were implicated in apoptosis, cell-cycle progression, collagen formation, heme pigment synthesis, and smooth muscle differentiation, while HDC and UC-MSC EVs were found to regulate complement activation, endopeptidase activity, and matrix metallopeptidases. Overall, miRNA and protein profiling reveal functional differences between three leading stem cell products. These findings provide a framework for mechanistic exploration of candidate therapeutic molecules driving the salutary effects of EVs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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