MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4323670147 · doi:10.1016/j.heliyon.2023.e14264

Establishing an effective clinical data collecting tool for optimal evaluation of native and allograft renal biopsies

2023· article· en· W4323670147 sur OpenAlexaffabout
Shifaa’ Al Qa'qa’, Rehab Al-Fatani, Sonia Rodríguez‐Ramírez, Prakash Gudsoorkar, Laurette Geldenhuys, Carmen Ávila-Casado

Notice bibliographique

RevueHeliyon · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueAI in cancer detection
Établissements canadiensNova Scotia Health AuthorityDalhousie UniversityHealth CanadaUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineMedical diagnosisHealth careKidneyPathologyMedical physicsInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Percutaneous kidney biopsy is the gold standard method to reach a precise diagnosis in most medical kidney diseases, which positively impacts patient care by personalizing the treatment. Accurate diagnosis in the pathology report for medical kidney diseases requires clinicopathological correlation, and clinical data is not always reachable to the nephropathologist. This study aimed to create a standardized, paperless requisition form compatible with medical renal biopsies. Methods: An initial form was prepared for native and allograft renal biopsies according to the current classification of medical kidney diseases. We invited 33 nephropathologists working in Canadian healthcare institutions to answer survey questions about the need to include a particular aspect of clinical information. According to the responses, we modified the experimental form. Eighty nephrologists were asked to complete a clinical data-collecting form given out as PDF files. The time for completing the form and clinicians' satisfaction were assessed. Results: The experimental form survey was answered by 20 out of 33 nephropathologists (61%) from 14 Canadian healthcare centers. The agreement rate on the questions was from 38.89% to 100.00% (average 83.33% and 77.14% for the native and the allograft section, respectively). Seventeen out of 80 nephrologists and their assistants (21%) responded by completing 22 PDF forms. The time required to finish a PDF form was 10.4 min on average. Nephrologists considered the form time-consuming and suggested making it more clinically relevant. Only seven nephrologists responded to the satisfaction survey; four (57%) were satisfied. Conclusions: Medical information is critical in renal pathology diagnoses. A uniform paperless clinical data requisition form was evolved through an agreement by Canadian nephropathologists.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,051
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,084
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,051
Score d'incertitude au seuil0,271

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0510,084
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0050,003
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,003
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,169
Tête enseignante GPT0,434
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueHeliyonMême sujetAI in cancer detectionTravaux en français237 207