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Enregistrement W4323809520 · doi:10.1002/adbi.202200322

Differentiation of Peritubular Myoid‐Like Cells from Human Induced Pluripotent Stem Cells

2023· article· en· W4323809520 sur OpenAlexaff
Meghan Robinson, Anne Haegert, Yen‐Yi Li, Tunç Morova, Angelina Yuan Yuan Zhang, Luke Witherspoon, Faraz Hach, Stephanie M. Willerth, Ryan Flannigan

Notice bibliographique

RevueAdvanced Biology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRenal and related cancers
Établissements canadiensUniversity of VictoriaOttawa HospitalUniversity of British ColumbiaUniversity of TorontoPrevention of Organ Failure
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTranscriptomeBiologyInduced pluripotent stem cellCell biologyImmunostainingCell typeStem cellPhenotypeDownregulation and upregulationCellGeneGene expressionImmunologyGeneticsEmbryonic stem cellImmunohistochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Infertility affects 10-15% of couples, with half attributed to male factors. An improved understanding of the cell-type-specific dysfunction contributing to male infertility is needed to improve available therapies; however, human testicular tissues are difficult to obtain for research purposes. To overcome this, researchers have begun to use human induced pluripotent stem cells (hiPSCs) to generate various testis-specific cell types in vitro. Peritubular myoid cells (PTMs) are one such testicular cell type that serves a critical role in the human testis niche but, to date, have not been derived from hiPSCs. This study set forth to generate a molecular-based differentiation method for deriving PTMs from hiPSCs, mirroring in vivo patterning factors. Whole transcriptome profiling and quantitative polymerase chain reaction (qPCR) show that this differentiation method is sufficient to derive cells with PTM-like transcriptomes, including upregulation of hallmark PTM functional genes, secreted growth and matrix factors, smooth muscle, integrins, receptors, and antioxidants. Hierarchical clustering shows that they acquire transcriptomes similar to primary isolated PTMs, and immunostaining shows the acquisition of a smooth muscle phenotype. Overall, these hiPSC-PTMs will allow in vitro study of patient-specific PTM development and function in spermatogenesis and infertility.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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