The phenotypic and genotypic spectrum of epilepsy and intellectual disability in adults: Implications for genetic testing
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: The phenotypic and genotypic spectrum of adult patients with epilepsy and intellectual disability (ID) is less clear than in children. We investigated an adult patient cohort to further elucidate this and inform the genetic testing approach. METHODS: Fifty-two adult patients (30 male, 22 female) with epilepsy, at least mild ID and no known genetic or acquired cause were included and phenotyped. Variants identified through exome sequencing were evaluated using ACMG criteria. Identified variants were compared with commercially available gene panels. Cluster analysis of two features, age at seizure onset and age at ascertainment of cognitive deficits, was performed. RESULTS: Median age was 27 years (range 20-57 years) with median seizure onset at 3 years and median ascertainment of cognitive deficits at 1 year. Likely pathogenic/pathogenic variants were identified in 16/52 patients (31%) including 14 (27%) single nucleotide variants and 2 (4%) copy number variants. Simulated yield of commercial gene panels varied between 13% in small (≤144 genes) and 27% in large panels (≥1478 genes). Cluster analysis (optimal number 3 clusters) identified a cluster with early seizure onset and early developmental delay (developmental and epileptic encephalopathy, n = 26), a cluster with early developmental delay but late seizure onset (ID with epilepsy, n = 16) and a third cluster with late ascertainment of cognitive deficits and variable seizure onset (n = 7). The smaller gene panels particularly missed the genes identified in the cluster with early ascertainment of cognitive deficits and later onset of epilepsy (0/4) as opposed to the cluster with developmental and epileptic encephalopathy (7/10). SIGNIFICANCE: Our data indicates that adult patients with epilepsy and ID represent a heterogeneous cohort that includes grown-up patients with DEE but also patients with primary ID and later onset of epilepsy. To maximize diagnostic yield in this cohort either large gene panels or exome sequencing should be used.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle