TCR Repertoire Analysis of CD4-Positive T Cells from Blood and an Affected Organ in an Autoimmune Mouse Model
Notice bibliographique
Résumé
Abstract One hallmark of some autoimmune diseases is the variability of symptoms among individuals. Organs affected by the disease differ between patients, posing a challenge in diagnosing the affected organs. Although numerous studies have investigated the correlation between T cell antigen receptor (TCR) repertoires and the development of infectious and immune diseases, the correlation between TCR repertoires and variations in disease symptoms among individuals remains unclear. This study aimed to investigate the correlation of TCRα and β repertoires in blood T cells with the extent of autoimmune signs that varies among individuals. We sequenced TCRα and β of CD4 + CD44 high CD62L low T cells in the blood and stomachs of mice deficient in autoimmune regulator ( Aire ) (AIRE KO), a mouse model of human autoimmune polyendocrinopathy-candidiasis-ectodermal dystrophy (APECED). Data analysis revealed that the degree of similarity in TCR sequences between the blood and stomach varied among individual AIRE KO mice and reflected the extent of T cell infiltration in the stomach. We identified a set of TCR sequences whose frequencies in blood might correlate with extent of the stomach manifestations. Our results propose a potential of using TCR repertoires not only for diagnosing disease development but also for diagnosing affected organs in autoimmune diseases.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».