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Enregistrement W4324018644 · doi:10.1007/s00122-023-04288-z

Genetic mapping of the powdery mildew resistance gene Pm7 on oat chromosome 5D

2023· article· en· W4324018644 sur OpenAlexaff
Sophie Brodführer, Volker Mohler, Melanie Stadlmeier, Sylwia Okoń, Steffen Beuch, Martin Mascher, Nicholas A. Tinker, Wubishet A. Bekele, Bernd Hackauf, Matthias Herrmann

Notice bibliographique

RevueTheoretical and Applied Genetics · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesBundesanstalt für Landwirtschaft und ErnährungBundesministerium für Ernährung und Landwirtschaft
Mots-clésBiologyPowdery mildewBlumeria graminisGeneticsGene mappingChromosomeReference genomeGenomeGenePlant disease resistanceBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

KEY MESSAGE: Three independent experiments with different genetic backgrounds mapped the resistance gene Pm7 in the oat genome to the distal part of the long arm of chromosome 5D. Resistance of oat to Blumeria graminis DC. f. sp. avenae is an important breeding goal in Central and Western Europe. In this study, the position of the effective and widely used resistance gene Pm7 in the oat genome was determined based on three independent experiments with different genetic backgrounds: genome-wide association mapping in a diverse set of inbred oat lines and binary phenotype mapping in two bi-parental populations. Powdery mildew resistance was assessed in the field as well as by detached leaf tests in the laboratory. Genotyping-by-sequencing was conducted to establish comprehensive genetic fingerprints for subsequent genetic mapping experiments. All three mapping approaches located the gene to the distal part of the long arm of chromosome 5D in the hexaploid oat genome sequences of OT3098 and 'Sang.' Markers from this region were homologous to a region of chromosome 2Ce of the C-genome species, Avena eriantha, the donor of Pm7, which appears to be the ancestral source of a translocated region on the hexaploid chromosome 5D.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,551
Score d'incertitude au seuil0,260

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,200
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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