MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4324116688 · doi:10.1016/j.gimo.2023.100075

P056: Three-dimensional nuclear telomere remodeling defines mechanisms of recurrence in glioblastomas

2023· article· en· W4324116688 sur OpenAlexaff
Macoura Gadji, Emile Fortin, David Fortin, Sabine Mai

Notice bibliographique

RevueGenetics in Medicine Open · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTelomeres, Telomerase, and Senescence
Établissements canadiensUniversity of ManitobaUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTelomereGlioblastomaCancer researchBiologyMedicineGeneticsDNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

samples to the sequencing read counts for either "buccal" or "granulocyte" (normal tissue) samples.Survival outcomes were assessed using a Kaplan-Meier web tool at cBioPortal for Cancer Genomics.The amplified group consists of gene copy numbers "tumor count" / "buccal count" or "granulocyte count" (normal tissue) above two.Ratios two and below were deemed the non-amplified group.Additionally, the correlation of FASLG CNV with RNA expression levels was analyzed.Results: The survival analysis of FASLG shows the amplified group samples to have decreased survival probabilities compared to those in the non-amplified group (p = 0.07).TNF, TRAIL, MYC, and BCL6 survival analysis did not approach a significant difference between amplified and non-amplified groups, p = 0.4, p = 0.4, p = 0.5, p = 0.4 respectively.RNA analysis showed a higher average RNA Seq value in the FASLG CNV amplified group compared to the nonamplified group.Conclusion: Utilizing copy number variation to explore the heterogeneity of tumor genomics has the potential to discover genes that impact prognosis of cancer patients.The idea of cancers upregulating death receptors such as FASLG, TRAIL, and TNF to potentially induce apoptosis of infiltrating lymphocytes is not well researched.Future studies include expanding FASLG CNV analysis to other cancers where FASLG is upregulated.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,068
Tête enseignante GPT0,338
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueGenetics in Medicine Open→Même sujetTelomeres, Telomerase, and Senescence→Travaux en français237 207→